计算化学公社

标题: 福井函数计算求助 [打印本页]

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nakamori    时间: 2025-11-19 22:00
标题: 福井函数计算求助
我最近在计算福井函数过程中,发现存在两种方法,1、单点能计算输出.wfn文件计算福井函数。2、使用.fchk文件得到.cube文件计算福井函数。请问这两种方法结果是否有差异?此外,对于过渡金属配合物二茂铁,使用PBE0/def2svp结构优化后,使用PBE0/def2tzvp的单点能计算fchk文件计算福井函数是否可行?感谢各位老师的解答



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邱诺狼    时间: 2025-11-19 22:51
本帖最后由 邱诺狼 于 2025-11-19 22:52 编辑

可参考社长写的blog操作:
使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量
http://sobereva.com/484

个人意见(假设你用的是Gaussian)
1.这两种方法理论上不应该有差异,有也是数值误差。这些操作在Multiwfn上就能自动处理。
2.泛函无问题,但建议加上DFT-D3(BJ)色散校正。还有不是做完优化就一了百了了,还要检验是否有虚频、波函数是否稳定。
波函数分析用Def2-TZVP基组做单点是浪费了,可以改成和优化时一样的Def2-SVP,详见这个blog:
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
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sobereva    时间: 2025-11-20 00:19
484博文的做法是计算福井函数最简单的做法,没有之一。自己按照Multiwfn手册4.5.4节手动产生wfn文件并用Multiwfn绘制密度差的功能得到福井函数亦可,但步骤更麻烦,而且还没法同时顺带得到各种概念密度泛函框架下定义的量。

分子内色散作用对二茂铁的构象不会产生影响,因此优化不用加D3校正,但如果以后要算柔性配体,色散作用可能明显影响构象,则加D3更适合,参考《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”》(http://sobereva.com/413)。但这种情况大多还需要同时用molclus(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)做构象搜索,以确保计算福井函数用的是最稳定结构。
福井函数的计算对基组并不敏感,若以后要算较大体系,用到6-311G*或def-TZVP那种较便宜的3-zeta基组就够了。def2-SVP也凑合。

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nakamori    时间: 2025-11-23 14:07
sobereva 发表于 2025-11-20 00:19
484博文的做法是计算福井函数最简单的做法,没有之一。自己按照Multiwfn手册4.5.4节手动产生wfn文件并用Mul ...

感谢sob老师的解答。对于您在http://sobereva.com/402中提到的使用VMD对福井函数进行可视化,如果想要可视化亲核进攻,是否在计算cube文件和使用VMD的过程中用N+1替换原文的N,N替换原文的N-1即
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sobereva    时间: 2025-11-24 02:36
nakamori 发表于 2025-11-23 14:07
感谢sob老师的解答。对于您在http://sobereva.com/402中提到的使用VMD对福井函数进行可视化,如果想要可 ...

用我前面484博文说的通过Multiwfn直接产生f+格点数据,要么Multiwfn里直接显示等值面,要么导出cube文件放VMD里显示
另外,下文的做法很有用,准确性往往比f+更好
使用Multiwfn通过局部电子附着能(LEAE)考察亲核反应位点、难易及弱相互作用
http://sobereva.com/676http://bbs.keinsci.com/thread-38416-1-1.html




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