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标题: 求助：如何计算模拟盒子中的分子个数 [打印本页]

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Author: Sunshine103 时间: 2025-11-21 15:30
标题: 求助：如何计算模拟盒子中的分子个数
初学GROMACS，我在按照文献给出的盒子大小进行建模时，发现自己用N=c×V×NA和N=ρ×V÷M×NA计算得到的分子数和文献给出的数字对不上。
尝试算了两篇文献，第一篇文献中盒子大小为10 Å × 10 Å × 10 Å，锂离子浓度为1 mol/L，溶剂为EC:DMC:EMC (1:1:1 vol%)，文献中给出的锂离子个数是60，EC、DMC、EMC分别是300、237、195，我自己算的只有0.6、3、2.38和1.94个。第二篇文献中盒子大小为 80×80×80 Å3，溶剂分子是DEGDME，文献中溶剂分子的个数是698个，我自己计算的是2169个。请问问题出在哪里？
文献一：https://doi.org/10.1016/j.jechem.2024.12.018
文献二：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c13011

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