计算化学公社

标题: 求助LAMMPS+PLUMED增强采样失败 [打印本页]

作者
Author:
chen0201    时间: 2025-11-25 10:05
标题: 求助LAMMPS+PLUMED增强采样失败
本帖最后由 chen0201 于 2025-11-25 10:07 编辑

请问各位老师们,我用的是cp2k的aimd数据作为deepmdkit训练得到的机器学习势函数,然后用于LAMMPS分子模拟,这过程都是正常的,然后我想通过PLUMED的metadynamics来采集高能量区域(aimd阶段发现这个是高能垒),主要是水分子中的CO2分子靠近K离子,其中K离子被溶剂化了的。这个过程我主要是想实现CO2靠近K的过程,最好是观察到K脱溶剂化的过程,但是我用第一种CV,即CO2的质心和K,会报错显示超过限制区域(限制的k-c质心距离范围已经是我想研究的范围了),我用了第二种CV,C-K距离,也是会报错显示超过限制区域,第三种,尝试了两个cv,一个是C-K距离,一个是K的溶剂化数量,可以限制中C-K仍然远离,已经改参数设置很多遍了。附件附上结构图、输入文件、报错信息。麻烦各位老师同学指点






欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3