计算化学公社

标题: 求助，NAdO分析时内存不够 [打印本页]

作者
Author: 计算消白 时间: 2025-11-25 22:29
标题: 求助，NAdO分析时内存不够
本帖最后由计算消白于 2025-11-25 23:26 编辑

用windows工作站先结构优化并计算了单点能，得到了.molden文件，将molden文件导入Multiwfn做NAdO分析（参考http://sobereva.com/719的2.3部分，社长的案例我试过了，在工作站上可以正常运行）。我用的命令窗口，发现问题好像是内存不够（如下图），如何解决这个问题？molden文件太大了没法上传。我上传了计算单点能的输入文件。
(, 下载次数 Times of downloads: 7)
体系：slab是Zn（256个原子），表面吸附一个COOH。
电脑配置：cpu 8375C 64核内存128G。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-26 02:09
找个内存大的机子在Linux下算，或者尝试把晶胞弄小点
还一个可尝试的办法是先用Multiwfn主功能6里的38 Make orbital occupations integer and satisfy Aufbau principle，让轨道占据数都重排成整数（单行列式波函数），然后再做NAdO分析，这样计算AOM的时候就不需要考虑空轨道了，能大幅节约内存

作者
Author: 计算消白 时间: 2025-12-3 17:42
本帖最后由计算消白于 2025-12-3 17:45 编辑

谢谢站长！我把体系缩小了，现在可以得到FOM，但在做BOD和NAdO分析时，出现一下错误：
Error: Only restricted and unresticted single determinant wavefunction are supported!
我把 http://sobereva.com/719 的Pd(100)表面吸附苯案例跑完了，没出现这个问题。
我修改了波函数，按照轨道能量由低到高重排占据数，还是不行。
我把吸附构型（.cif）和单点能计算文件上传了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-4 11:05

计算消白发表于 2025-12-3 17:42
谢谢站长！我把体系缩小了，现在可以得到FOM，但在做BOD和NAdO分析时，出现一下错误：
Error: Only restri ...

Multiwfn里重排轨道占据数后没理由出现此问题。本身此体系的类型和Pd(100)表面吸附苯没有本质区别
至少不通过网盘给出压缩后的molden文件我没法测试
如果不点我帖子下方回复按钮进行回复，99%概率我看不到

作者
Author: 计算消白 时间: 2025-12-4 13:11

sobereva 发表于 2025-12-4 11:05
Multiwfn里重排轨道占据数后没理由出现此问题。本身此体系的类型和Pd(100)表面吸附苯没有本质区别
至少 ...

谢谢站长！我把压缩后的 .molden 文件用网盘上传了：
通过网盘分享的文件：Zn_COOH_energy_smear-MOS-1_0.7z
链接: https://pan.baidu.com/s/1-Vvf0XTXgCeYcm5XIa__Iw 提取码: p89s
--来自百度网盘超级会员v6的分享

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-4 15:32

计算消白发表于 2025-12-4 13:11
谢谢站长！我把压缩后的 .molden 文件用网盘上传了：
通过网盘分享的文件：Zn_COOH_energy_smear-MOS-1 ...

&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1让alpha和beta电子数差值保持为1可解决

作者
Author: 计算消白 时间: 2025-12-4 17:19
本帖最后由计算消白于 2025-12-4 17:22 编辑

sobereva 发表于 2025-12-4 15:32
&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1让alpha和beta电子数差值保持为1可解决

1. 谢谢社长！在&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1后，上述问题解决了。
2. 得到 .molden文件后，我在用FOM做NAdO分析时，按照http://sobereva.com/719 Pd(100)表面吸附苯的步骤：设置片段1为COOH，片段2为和C相连的Zn（编号84），发现Zn表面吸附COOH后，1号NAdO轨道成分主要由Zn和C的s和p轨道贡献，Zn的d轨道贡献很小。感觉结果不太对？Zn的d轨道怎么贡献这么小？

我把吸附构型、1号NAdO轨道、轨道成分的截图放上了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-4 21:55

计算消白发表于 2025-12-4 17:19
1. 谢谢社长！在&SMEAR里加上FIXED_MAGNETIC_MOMENT 1后，上述问题解决了。
2. 得到 .molden文件后，我 ...

本来Zn就是d壳层满占据，和Pd的成键明显不同

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