计算化学公社

标题: 求助在超算平台使用sobEDA和sobEDAw方法做能量分解 [打印本页]

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作者
Author: fornacis    时间: 2025-11-26 23:06
标题: 求助在超算平台使用sobEDA和sobEDAw方法做能量分解
看到了sob老师的（使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析），但是里面关于如何在超算平台做能量分析的帖子要level 4才能阅读http://bbs.keinsci.com/thread-47947-1-1.html，各位大佬可不可以发出来让我看一下，非常感谢！

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作者
Author: student0618    时间: 2025-11-27 00:27
如果是SLURM的话，可直接在脚本顶部加各种SBATCH指令及Gaussian 和Multiwfn环境变量，然后sbatch 修改后的脚本。

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作者
Author: fornacis    时间: 2025-11-27 15:06

student0618 发表于 2025-11-27 00:27
如果是SLURM的话，可直接在脚本顶部加各种SBATCH指令及Gaussian 和Multiwfn环境变量，然后sbatch 修改后的 ...

我对slurm不是很懂，也没有本地的linux，想看看有没有用超算计算能量分解的教程

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作者
Author: student0618    时间: 2025-11-27 15:51


假设集群用SLURM

就直接用sob老师的教程，文本编辑器打开sobEDA.sh，最上方加例如

1. #!/bin/bash
   
2. #SBATCH -J sobEDA
   
3. #SBATCH -n 1
   
4. #SBATCH -c 8
   
5. #SBATCH -p cpu
   
6. 
   
7. 这边写高斯的环境变量
   
8. 
   
9. 这边写Multiwfn的环境变量
   
10. 
    
11. 下面Sob老师的脚本不用改

复制代码

-n 是用多少mpi thread
-c 是每个mpi多少cpu
-p 是队列，请根据集群改

然后像教程在Shell运行sobEDA.sh一样sbatch sobEDA.sh

结果会在slrum-JOBID.out找到

pbs的话就不同了，我没试。

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作者
Author: fornacis    时间: 2025-11-27 20:20

student0618 发表于 2025-11-27 15:51
假设集群用SLURM

就直接用sob老师的教程，文本编辑器打开sobEDA.sh，最上方加例如

好的，谢谢老师，我先试试

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