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标题: Gaussian计算IRC后取端点优化,多个基元反应重合的中间体取什么能量 [打印本页]

作者
Author:
wangdan    时间: 2025-11-27 14:18
标题: Gaussian计算IRC后取端点优化,多个基元反应重合的中间体取什么能量
我研究的是一个酶的催化反应,有多个基元反应,其中我优化的过渡态2和过渡态3,都只有一个虚频,分别对两个过渡态走IRC,曲线都是平滑正常的,然后取IRC曲线的两个端点优化 ,并计算smd和sp,最后整合计算的能量取哪一个呢?计算使用参数如下:
过渡态优化opt:# p opt=(ts,calcfc,noeigen) B3LYP/6-31G(d,p) em=gd3bj
中间体优化:#p opt=gdiis freq b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3bj
smd计算:#p B3LYP/6-31G(d,p) scrf=(smd,solvent=generic,read) em=gd3bj   eps=4.0
sp计算:# p B3LYP/6-311+G(2d,2p) em=gd3bj


作者
Author:
Voidmio    时间: 2025-11-29 19:18
按理来说,你描述的这两个端点结构优化后应该是完全相同的,否则你凭什么能将之分别与两端用虚线连接起来?




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