计算化学公社

标题: 二聚物链拓扑文件非整数电荷报错问题 [打印本页]

作者
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十四~    时间: 2025-11-28 20:59
标题: 二聚物链拓扑文件非整数电荷报错问题
力场为gromacs自带的OPLS_AA/L,电荷类型1.2xCM5,用Marvin JS生成的结构,聚合物链所有分子电荷的和为-47.53,不为整数,请问是什么问题,应该如何解决?
NOTE 1 [file topol.top, line 23]:
  System has non-zero total charge: -47.530001
  Total charge should normally be an integer. See
  http://www.gromacs.org/Documentation/Floating_Point_Arithmetic
  for discussion on how close it should be to an integer.


作者
Author:
sobereva    时间: 2025-11-29 05:46
尝试:
可生成任意聚合度线形聚合物结构、拓扑以及电荷的在线程序
http://bbs.keinsci.com/thread-55201-1-1.html





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