计算化学公社

标题: 复合物结合能计算问题求助 [打印本页]

作者
Author: yangna11 时间: 2025-12-4 17:25
标题: 复合物结合能计算问题求助
各位老师好，我计算了化合物A分别与20种不同的化合物B形成的AB复合物的结合自由能（ΔGbind），结合能（ΔEbind）以及相互作用能（ΔEint）,其中ΔGbind和ΔEbind是添加了隐式溶剂模型计算出来的，而ΔEint是用sobEDA方法算出来的，没有考虑变形能以及溶剂效应。计算出来的结果显示，20种复合物的ΔGbind，ΔEbind以及ΔEint三个参数趋势不一致，比如复合物1有最负的ΔEbind，但是复合物1对应的ΔEint缺不是最负，请问这是正常的吗，这样的数据可以拿来用吗以及放在文章里比较。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-5 11:56
手动计算相互作用能，确保sobEDA给你的和手算的一致
并且自己算变形能、溶解自由能，弄清楚这俩因素怎么影响结合，参考下文的讨论
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733（http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html）

作者
Author: yangna11 时间: 2025-12-5 13:31

sobereva 发表于 2025-12-5 11:56
手动计算相互作用能，确保sobEDA给你的和手算的一致
并且自己算变形能、溶解自由能，弄清楚这俩因素怎么影 ...

谢谢老师指导

作者
Author: yangna11 时间: 2025-12-8 17:30

yangna11 发表于 2025-12-5 13:31
谢谢老师指导

老师，还想请教一下变形能应该怎么算。

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