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标题: 3-氨基丙基三乙氧基硅烷分子作能量极小化断键 [打印本页]

作者
Author: lixiang123 时间: 2025-12-4 19:32
标题: 3-氨基丙基三乙氧基硅烷分子作能量极小化断键
老师们，用sobtop产生3-氨基丙基三乙氧基硅烷的拓扑文件。按照先导入原子电荷，然后指认GAFF原子类型，没法指认的自动用UFF原子类型，再用fchk文件里的Hessian矩阵生成拓扑文件。然后用这个分子去跑能量极小化，跑完不收敛，而且Si-O键断开了。这是Si-O键参数不对造成的吗？
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作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-5 12:02
又是胡乱用Hessian矩阵算力常数的情况，认真看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ11
至于直接原因，参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8检查

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