计算化学公社

标题: 锂电解液中离子网络和水氢键网络如何绘制 [打印本页]

作者
Author:
aipacino    时间: 2025-12-4 20:39
标题: 锂电解液中离子网络和水氢键网络如何绘制
求助各位老师,我用lammps模拟得到轨迹文件,如何才能得到类型于下面这幅图的离子网络和水氢键网络示意图?用vmd还是ovito等其他软件?详细步骤是怎样的?



作者
Author:
sobereva    时间: 2025-12-5 12:07
根本没显示出什么所谓的网络。纯粹是VMD里把Na和water两个组用quicksurf风格显示而已
作者
Author:
aipacino    时间: 2025-12-5 15:45
本帖最后由 aipacino 于 2025-12-5 17:00 编辑
sobereva 发表于 2025-12-5 12:07
根本没显示出什么所谓的网络。纯粹是VMD里把Na和water两个组用quicksurf风格显示而已

谢谢老师,我尝试了一下感觉一点也不好看:

那这篇文章提到的离子网络和水氢键网络还有更好的表达方式吗,参考文献是:
10.1021/jacs.8b07696

作者
Author:
yuzc    时间: 2025-12-15 16:51
aipacino 发表于 2025-12-5 15:45
谢谢老师,我尝试了一下感觉一点也不好看:

那这篇文章提到的离子网络和水氢键网络还有更好的表达方式 ...

不如用aNCI给出相互作用区呢。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3