计算化学公社

标题: 如何绘制阴离子体系的分子间静电势图 [打印本页]

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Sharkler    时间: 2025-12-4 21:22
标题: 如何绘制阴离子体系的分子间静电势图
请教各位老师,如何绘制阴离子体系的分子间静电势图。例如Au-···H2O以氢键相连的体系,电荷主要在Au原子上。看了老师的“使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图”,中性的体系可以将两个分子电荷各为0单独计算,但是阴离子的体系,电荷不完全在Au原子上,给Au一个电荷计算是不是不行,不知该如何操作。

作者
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sobereva    时间: 2025-12-5 12:33
片段状态的选取取决于自己,取决于你是想考察Au-和H2O的相互作用还是Au和[H2O]-的相互作用。鉴于气相下,Au的电子亲和能为正,可以稳定额外结合电子,而H2O不行,因此前者更有意义。
作者
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Sharkler    时间: 2025-12-5 14:16
sobereva 发表于 2025-12-5 12:33
片段状态的选取取决于自己,取决于你是想考察Au-和H2O的相互作用还是Au和[H2O]-的相互作用。鉴于气相下,Au ...

谢谢sobereva老师的回复,但是更多情况下Au的电荷并不是完全-1的,比如-0.89这种该怎么办呢。
作者
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sobereva    时间: 2025-12-5 16:34
Sharkler 发表于 2025-12-5 14:16
谢谢sobereva老师的回复,但是更多情况下Au的电荷并不是完全-1的,比如-0.89这种该怎么办呢。

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