计算化学公社

标题: 如何模拟水分子通过MOF膜？ [打印本页]

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2025-12-6 09:34
标题: 如何模拟水分子通过MOF膜？
各位老师好，我在模拟水分子通过MOF膜的分子动力学，用了GAFF/UFF力场和NVT系综，温度298.15K，模拟了10ns。水分子在模拟过程中主要朝着x方向左右移动（黑线），没有经过z轴穿过MOF膜（红线），请问该怎么设置模拟参数？

作者
Author: 1601452201 时间: 2025-12-6 10:11
在这么大空间内，先自由扩散一下应该是很正常的，建议在两端加石墨烯板防止水分子通过周期性跑到另一端

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-6 11:59
要先说明打算模拟什么机制下水穿越MOF，是自发扩散过去，还是加压什么的。而且就拿这么一团水（跟纳米液滴似的）来模拟也很奇怪

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2025-12-6 13:35

sobereva 发表于 2025-12-6 11:59
要先说明打算模拟什么机制下水穿越MOF，是自发扩散过去，还是加压什么的。而且就拿这么一团水（跟纳米液滴 ...

sob老师好，实验上是少量水蒸气，常温，没有加压的，我packmol构建的时候加少了，我再加点水分子进去。

自发扩散的话是不是只能加热加速扩散了？

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2025-12-6 13:36

1601452201 发表于 2025-12-6 10:11
在这么大空间内，先自由扩散一下应该是很正常的，建议在两端加石墨烯板防止水分子通过周期性跑到另一端

我水分子加少了，应该是空间布满水分子的

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-6 14:37

yaoyuan0711 发表于 2025-12-6 13:35
sob老师好，实验上是少量水蒸气，常温，没有加压的，我packmol构建的时候加少了，我再加点水分子进去。
...

是

作者
Author: 1601452201 时间: 2025-12-10 19:02
或者你膜前膜后有浓度梯度这种情况也可以自发进行，不加压的情况下

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)