计算化学公社

标题: 请问如何快速得到大量肽段的结构文件？ [打印本页]

作者
Author: 王涛 时间: 2025-12-6 09:49
标题: 请问如何快速得到大量肽段的结构文件？
我研究的对象是六肽。我想建一个六肽库。我目前得到六肽结构的方法是用Gabedit一个一个构建的，这个软件支持封端和质子化操作，但是他是一个一个点击氨基酸最后生成肽的结构的，效率比较低。请问有没有什么其他软件可以快速的输入序列就可以生成结构，并且可以进行封端和质子化操作的呢？

作者
Author: KazusaT 时间: 2025-12-6 10:15
rdkit

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-6 11:56
几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具
http://sobereva.com/687（http://bbs.keinsci.com/thread-40331-1-1.html）
使用里面的基于命令行的工具

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