计算化学公社

标题: AdNDP中轨道问题求助 [打印本页]

作者
Author:
麦克疯    时间: 2025-12-6 15:56
标题: AdNDP中轨道问题求助
各位老师前辈好,最近在复现一篇分析多中心键的文献《[size=15.9403pt]Deciphering the mystery of hexagon holes in an all-boron graphene
[size=15.9403pt]a[size=15.9403pt]-sheet
其中要对α片层中截取的三个片段(B7、B22、B30)做AdNDP分析,用到了我们的软件Multiwfn
(, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 1)

先在Gaussian中优化计算然后进行AdNDP分析。
其中对B7片段的操作完全符合论文中所描述的结果:出现了6个3c-2e键和1个7c-2e键。
但对第二个片段B22进行分析时,符合文献中结果的18个3c-2e键,但是未能出现文献中3个4c-2e键,而是出现了别的键。
同时我对B30片段分析时多中心键也与论文中的结果不同。

我看了sob老师的那片文章《[size=1.4em]使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键》,其中提到了有时需要分批将轨道取出,我不知道是不是和这个有关。而且我没太搞懂这个分批取出中分批依据规则,想问问有没有处理过相似问题的老师。由于我以前是计算机专业的学生,刚接触这部分内容,我想或着是由于我的哪部分理论欠缺导致。

感谢了解的老师前辈赐教,万分感谢





作者
Author:
sobereva    时间: 2025-12-6 16:17
取轨道的基本原则和思想在博文里该说的都说了,先把例子仔细重复一遍
简并的轨道通常一次都取出来,除非彼此间有显著重叠

一些AdNDP文献里取的轨道并不理想,甚至定性错误。如果你非要重复文献里的结果,就按文献所示的在Multiwfn取,并且计算级别要和文献严格一致;如果相应轨道没在Multiwfn里作为候选轨道显示出来,把占据数阈值设低后再试。

作者
Author:
麦克疯    时间: 2025-12-6 16:31
sobereva 发表于 2025-12-6 16:17
取轨道的基本原则和思想在博文里该说的都说了,先把例子仔细重复一遍
简并的轨道通常一次都取出来,除非彼 ...

好的谢谢老师指点




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3