计算化学公社

标题: 集群任务提交问题 [打印本页]

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2017-5-1 20:47
标题: 集群任务提交问题
最近在用集群做第一原理计算，有一系列的计算要做，但是这系列任务中每一个step的计算需要上一个step的结果，目前我在自己的小工作站上能够实现，但是在集群上面，需要分配结点用bsub或qsub来提交任务，这样shell脚本到bsub或qsub后会直接往下执行，不会等到这个step算完再往下执行，所以也就没法提取结果了。
不知道问题描述清楚了没有，在网上不好搜索，所以希望论坛的大神们快快现身

作者
Author: plus 时间: 2017-5-1 21:09
作业脚本里可以写好多个命令，一行的命令结束后运行下一行
比如vasp吧

vasp
command to read results
creat new input file

vasp
command to read results
creat new input file

vasp
command to read results
creat new input file

vasp
command to read results
creat new input file

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