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标题: MD进行周期性高温退火发生报错的问题 [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2025-12-10 22:06
标题: MD进行周期性高温退火发生报错的问题
我用gromacs跑4000K的周期性高温退火循环，模拟过程中体系总是出现这个报错，请问这是为什么呢？我把温度改成2000K就可以正常跑起来，4000K要怎样才能正常跑起来呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-10 23:12
大概率是体系崩了
自行用VMD看轨迹最后一段时间估计是什么导致的
并且温度越高，原子整体运动速度越快，越应该用小步长确保动力学的数值稳定性

gen_vel = yes
gen_temp = 4000
这种设置是完全不可接受的，很可能导致有原子的初速度极大令体系崩溃。应当设no

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