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标题: 能否将gromacs的densmap命令产生的.xpm文件转化成能用于origin画图的数据格式 [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2025-12-22 08:51
标题: 能否将gromacs的densmap命令产生的.xpm文件转化成能用于origin画图的数据格式
请问能否将gromacs的densmap命令产生的.xpm文件转化成能用于origin画图的数据格式，就是转成txt或者xvg之类的

作者
Author: student0618 时间: 2025-12-22 13:17
看看这帖是否楼主需要的：

GROMACS产生的xpm快速绘制美观的图
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

作者
Author: FrancisCho 时间: 2025-12-22 17:06
这个我一直在用，我是魔改了二楼提到的帖子里的Python代码后应用到我自己的画图。在代码的最后一行更改为gmx densmap生成的xpm文件
# 处理指定的四个文件
file_list = ['densmap-o.xpm', 'densmap-na.xpm', 'densmap-k.xpm']
然后将Python代码放到xpm文件所在文件夹（我默认是Windows，因为要用Origin），在终端执行"python xpm.py"后生成densmap-k_matrix.dat，使用Notepad（任选版本）打开dat文件，全选，打开Origin，在项目管理器内右键新建窗口里选择矩阵，将dat文件内容全选复制粘贴进矩阵内，然后在矩阵左上角设置XY标签与Z标签，全选，点击绘图-等高线图-等高线图-颜色填充后即可在Origin内设置颜色填充。

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