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标题: Gaussian 能量计算l202错误 [打印本页]

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Asanumber    时间: 2017-5-3 18:44
标题: Gaussian 能量计算l202错误
最近帮师兄做一些分子的结构优化和能量计算。本来这些计算相对简单,不会出什么问题;但今天在计算分子能量的过程中,却遇到了如下错误:        本人使用的是Gaussian09 C01,系统为Ubuntu,所用基组为6-311G(d),泛函为B3LYP。

        首先,将并五苯分子的电荷设置为-1,多重度设置为2,对其进行几何优化,得到结构A;

        然后,将A结构在GaussView上读取,保存gjf,并将gjf的电荷改为0,多重度改为1,即为附件的gjf;
        最后,问题出现了。用Gaussian对该gjf进行能量计算时,返回错误,log文件显示:logic error in ASyTop. Error termination via Lnkle in ***/l202.exe。
这种错误貌似比较罕见,没有发现靠谱的解决方案。所以,在这里求助各位,请问该计算错误的根源在哪里?有哪些可行的办法解决吗?谢谢了。

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liyuanhe211    时间: 2017-5-3 19:37
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-5-3 19:42 编辑

只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题,但具体原因还没搞清楚。
(, 下载次数 Times of downloads: 40)

(已排除版本(不含G16)、geom=connectivity、核数与内存的影响)


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Asanumber    时间: 2017-5-3 19:59
liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题,但具体原因还没搞清楚。

这个难道是Gaussian的一个bug吗?问题很罕见,真是太寸了,被我赶上了。不过多谢大神帮忙啊,计算可以接着做了。
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sobereva    时间: 2017-5-4 11:02
这种高对称体系,高斯计算前一定要在gview里先对称化一下。从你的输入坐标里看,z值都带一些数值噪音,就算高斯不报错,算起来也比D2h对称性下慢得多得多。
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Asanumber    时间: 2017-5-4 13:44
sobereva 发表于 2017-5-4 11:02
这种高对称体系,高斯计算前一定要在gview里先对称化一下。从你的输入坐标里看,z值都带一些数值噪音,就算 ...

多谢指点。
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leebo    时间: 2017-10-7 03:22
liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题,但具体原因还没搞清楚。

g16也出现了这个错误。
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naonao5205    时间: 2020-6-25 15:31
在计算四氰基乙烯的时候出现了这个问题 去掉symm=loose就不报错了(g16 a03)
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lycheeho    时间: 2023-5-29 08:41
liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题,但具体原因还没搞清楚。

你好!请问如何实现分子坐标整体旋转一定角度的呢?
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liyuanhe211    时间: 2023-5-29 14:36
lycheeho 发表于 2023-5-29 08:41
你好!请问如何实现分子坐标整体旋转一定角度的呢?

GaussView按住Alt拖动
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lycheeho    时间: 2023-5-29 17:44
liyuanhe211 发表于 2023-5-29 14:36
GaussView按住Alt拖动

谢谢~




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