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标题: 不同温度下丙二醇甲醚醋酸酯分子簇构象的确定 [打印本页]

作者
Author: perpetual.. 时间: 2025-12-25 21:43
标题: 不同温度下丙二醇甲醚醋酸酯分子簇构象的确定
请问想确定不同温度下液态丙二醇甲醚醋酸酯分子所形成的分子簇中的分子个数和配对方式，需要使用哪些软件以及工作的大体流程是什么呢？

作者
Author: student0618 时间: 2025-12-25 23:26
可以用GROMACS跑MD再写脚本分析统计个数。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-26 03:37
先用GROMACS跑相应温度下的MD。簇中的分子个数往往可以靠gmx clustsize分析。配对方式需要自己写VMD tcl脚本等方式统计分析

如果不了解相关计算、分析和脚本编写，推荐学北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX），这些都是培训里详细讲了的。

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