计算化学公社

标题: spartan 08搜索构象使用求助 [打印本页]

作者
Author: xuj 时间: 2017-5-4 11:05
标题: spartan 08搜索构象使用求助
求教各位大神：我最近在自学量子化学计算天然产物绝对构型，在使用spartan 08搜索构象过程中出现了问题，具体使用过程和问题如下
1.在chemdraw中画出化合物的结构二维结构，并存储为sdf格式的文件，保存路径为英文
2. 用spartan 08打开上述的sdf文件，点setup——calcultions后设置参数如图
3. 点submit提示保存（按提示执行保存），之后弹出spartan已经开始的窗口，点击ok
4.但仅接着出现出错的对话框，见图2
请问各位可能是什么原因造成的？谢谢

作者
Author: ggdh 时间: 2017-5-4 12:46
先试试：chemdraw 保存的sdf文件能够用spartan 做优化嘛？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-5-4 13:09
任务保存时保存为.spartan后缀试一下

作者
Author: xuj 时间: 2017-5-4 13:50

ggdh 发表于 2017-5-4 12:46
先试试：chemdraw 保存的sdf文件能够用spartan 做优化嘛？

你好，你说的是minimize吗？这个是可用，并显示完成状态的

作者
Author: xuj 时间: 2017-5-4 13:54

liyuanhe211 发表于 2017-5-4 13:09
任务保存时保存为.spartan后缀试一下

你好，保存的时候软件默认的为spartan格式

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-5-4 15:36

xuj 发表于 2017-5-4 13:54
你好，保存的时候软件默认的为spartan格式

某个版本的Spartan保存时，即使选择spartan格式，只要默认的文件名以.sdf扩展名结束即不正常。手工将扩展名修改为.spartan就可以。

作者
Author: xuj 时间: 2017-5-4 17:10

liyuanhe211 发表于 2017-5-4 15:36
某个版本的Spartan保存时，即使选择spartan格式，只要默认的文件名以.sdf扩展名结束即不正常。手工将扩 ...

多谢，解决了！

作者
Author: qcn 时间: 2017-8-23 10:30
spartan 软件的缺陷是什么？在做构象搜索时体系双键的顺反异构和手性中心的构型会发生改变吗？有些帖子说 “spartan搜索到的所有构象中，环的扭曲方向与输入构象一致，不会自动扭转"

作者
Author: kyuu 时间: 2017-8-23 12:40

qcn 发表于 2017-8-23 10:30
spartan 软件的缺陷是什么？在做构象搜索时体系双键的顺反异构和手性中心的构型会发生改变吗？有些帖子说 ...

Q-chem的缺陷是什么

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