计算化学公社

标题: Mayer键级判断是否形成配位键 [打印本页]

作者
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。。。    时间: 2026-1-3 20:03
标题: Mayer键级判断是否形成配位键
各位老师好,我现在计算了一个COF体系可以很好地吸附水中的HgCl2,我通过gromacs计算发现COF上有-SCH3和=O时,吸附HgCl2的效果最佳,其次是只含有-SCH3的COF,最后是只含有=O的COF,然后实验上测XPS只能观察到Hg-S之间存在相互作用,Hg-O之间不会存在相互作用。但是提取了gromacs所跑轨迹中的几帧轨迹,使用CP2K进行单点能计算,得到.molden文件,计算Mayer键级,但是得到Hg-S和Hg-O之间键级分别为0.22和0.13,这是否说明了Hg与O和S都存在配位作用?那这样与实验结果又匹配不上,还是说我需要需要做其他分析吗?

作者
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sobereva    时间: 2026-1-3 22:06
不建议直接拿经典力场的动力学的结构直接算波函数文件后用Multiwfn算Mayer键级,力场的精度过于粗糙。哪怕先做一下几何优化也好
提问时主动说清楚计算级别,否则数据没意义





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