计算化学公社

标题: SMD固定端的问题 [打印本页]

作者
Author: HanLuyao 时间: 2026-1-5 10:11
标题: SMD固定端的问题
我在进行SMD模拟的时候，对一端进行固定，另一端进行拉伸，为什么我的模拟轨迹中没有没有很明显的固定的现象呢，如何从轨迹中很明显的看出固定呢？

作者
Author: pal 时间: 2026-1-5 10:25
固定的话对应的原子就完全不会动，位置限制的话就在一定范围内振动，把轨迹载入vmd很容易看到

作者
Author: Myth 时间: 2026-1-5 11:10
被固定的分组是通过什么方法固定的？冻结的话是完全不会移动的，把固定的分组的原子序号用serial关键词在vmd里面用特殊模式显示出来，就能判断有没有真的冻结住了。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-1-6 00:59
要么固定设置不对，要么开了消平动所致

作者
Author: HanLuyao 时间: 2026-1-6 09:57
原来如此，我是进行的位置限定，所以在一定范围内进行了波动，想问各位老师怎么进行的固定呢

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