计算化学公社
标题:
粗粒化链首少bead
[打印本页]
作者Author:
HanLuyao
时间:
2026-1-6 10:46
标题:
粗粒化链首少bead
在AA转换成CG结构的时候,由于我的体系太大,我将链进行了拆分,然后跑了martinize2,但是只有A链的N端top包含两个bead,其他的链N端只有一个bead(缺少BB)。下面是A链和B链的top部分,两条链是一样的,生成的top也不一样
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
上传 Uploaded
点击下载Click to download
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
上传 Uploaded
点击下载Click to download
作者Author:
student0618
时间:
2026-1-6 14:21
链是一样的话生成一条,topology 的 [ molecules ] 下写两个就可以了。
作者Author:
HanLuyao
时间:
2026-1-6 21:39
student0618 发表于 2026-1-6 14:21
链是一样的话生成一条,topology 的 [ molecules ] 下写两个就可以了。
但是还有其他不一样的链,也是出现链首少BB这个bead的情况
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3