计算化学公社

标题: ms forcite 里面的dynamic 以及dmol里面的dynamic区别? [打印本页]

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3044305615    时间: 2015-1-5 20:30
标题: ms forcite 里面的dynamic 以及dmol里面的dynamic区别?
新手,很多问题可能问的有些白痴,但是自己网上查过 还是不甚了解

1、在ms软件当中  forcite  里面有dynamic   而 dmol 里面也有dynamic此项  ,想问下 两个dynamic的区别是什么?
2、分子力场指的是经典动力学模拟么?  分子力学,分子动力学,经典动力学 这几个定义不明了,能麻烦帮忙解答一下么,多谢



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sobereva    时间: 2015-1-5 20:48
有了势函数(能量与核坐标的关系),才能做动力学模拟。动力学模拟可以基于经典力场(或者叫分子力学),即forcite/discover的情况,也可以基于量子化学方法,即dmol的情况,这也被称为从头算动力学。

“经典动力学”这个词比较含糊。要看从哪层含义上区分经典和量子。有时是从势函数上是基于经典力学还是量子力学计算来区分。有时候是从对于原子核的处理上来区分,是通过BOMD这样基于牛顿运动方程方式考虑核的运动,还是将原子核视为量子而通过求解薛定谔方程来处理。
作者
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平辉正    时间: 2015-1-5 20:52
dmol是AIMD。

Forcite是经典分子力学工具,可以对分子或周期性体系进行快速的能量计算及可靠的几何优化还可以进行刚体优化以及动力学模拟,可以实现模拟淬火、退火等功能。
•包含了Universal、Dreiding 等被广泛使用的力场和PCFF、CVFF力场,并可以使用COMPASS力场以及多种电荷分配算法。支持二维体系的能量计算,可以对固态体系进行研究,如晶体、非晶和溶剂化体系,一整套的分析工具可用来对诸如偶极相关等复杂性质进行分析;同时还可以分析 Discover 所产生的.arc和.his 轨迹文件,能够得到各类结构参数、热力学性质、力学性质、动力学量以及振动强度。
•该模块能够使用Perl Script功能编译。




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