计算化学公社

标题: gromacs模拟锂离子电池电解液，混合溶剂体系压力波动很大 [打印本页]

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Author: 小天才 时间: 2026-1-9 21:01
标题: gromacs模拟锂离子电池电解液，混合溶剂体系压力波动很大
我的文件如下所示，但是在进行NPT系综进行模拟的时候，压力项波动很大，想请教一下原因是什么？我的itp文件时用Sobtop生成的。

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Author: student0618 时间: 2026-1-9 21:30
以下帖子搜压力：

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 2&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

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Author: 小天才 时间: 2026-1-10 10:37

student0618 发表于 2026-1-9 21:30
以下帖子搜压力：

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡

我看过这个，但是我通过gmx energy -f eq.edr 选项里面并没有密度选项。另外我在进行NPT模拟的时候我的倒计时一直不怎么波动。

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Author: yuzc 时间: 2026-1-22 15:30

小天才发表于 2026-1-10 10:37
我看过这个，但是我通过gmx energy -f eq.edr 选项里面并没有密度选项。另外我在进行NPT模拟的时候我的倒 ...

这个回复，结合你的压力涨落大，怀疑你实际运行的mdp文件和你提交的mdp不是一个文件，你可能实际跑的时候用了NVT。

作者
Author: 小天才 时间: 2026-1-30 16:57

yuzc 发表于 2026-1-22 15:30
这个回复，结合你的压力涨落大，怀疑你实际运行的mdp文件和你提交的mdp不是一个文件，你可能实际跑的时候 ...

好的，谢谢，我再尝试一下

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