计算化学公社
标题: 求助DFT/TDDFT下single-electron-transfer(SET)的计算内容 [打印本页]
作者Author: Jayna 时间: 2026-1-10 13:35
标题: 求助DFT/TDDFT下single-electron-transfer(SET)的计算内容
本帖最后由 Jayna 于 2026-1-10 13:43 编辑
我是新手小白,确定了体系后自己通过文献、公社帖子和sob老师的博文学习了很多,最近学得非常吃力和迷茫,遂求助各位老师同学~
反应过程是:Cat[Fe(II)]和有机物(3a)两分子之间结合发生单电子转移(SET),有机物(3a)往Cat[Fe(II)]上转移一个电子,生成Cat[Fe(I)]和自由基(3a+),随后3a+自由基脱掉一个H+形成中性自由基(3a`)
我目前的计算为:
(1)计算基态和激发态几何结构,Cat[Fe(II)]、3a、Cat[Fe(II)]-3a聚合物、Cat[Fe(I)],来判断Cat[Fe(II)]的激发方式和Cat[Fe(II)]-3a聚合物的作用方式(pipi堆积?偶极-偶极相互作用?…)
(2)计算自由基,3a+、3a`的激发态几何结构;3a+单点能、3a`加H+单点能
拟进行的计算:SET速率,这里要计算三个参数分别是重组自由能、Gibbs自由能变、初始状态和最终状态之间的电子耦合。
(1)重组自由能参照:
http://sobereva.com/330
(2)Gibbs自由能变参照:
http://sobereva.com/327;http://sobereva.com/552
遇到的的问题:
(1)Cat[Fe(II)]的基态在自旋多重度为1、3、5优化成功,其中Cat[Fe(II)]自旋多重度为5的能量最低。Cat[Fe(II)]激发态只有自旋多重度为1的几何优化成功,自旋多重度为3和5根据sob老师帖子【解决SCF不收敛问题的方法】在逐一和组合尝试一直未成功(后附文件),目前正在进行用开壳层读取闭壳层收敛的波函数且stable=opt,随后再进行opt TD计算。
(2)Cat[Fe(II)]-3a聚合物(后续称polymer)激发态的几何结构优化失败情况同Cat[Fe(II)]。
(3)请问我该从什么角度去分析和解释”3a+自由基脱掉一个H+形成中性自由基(3a`)”呢?有没有可借鉴的文献或博文呢?
(4)我对于SET速率的计算思路是正确的嘛?”初始状态和最终状态之间的电子耦合”这个问题我看了论坛和一些文献始终没有清晰的思路,是否有较为全面成体系的文献或者博文呢?
小说明:Cat[Fe(II)]有71个原子;polymer有108个原子;GS为Ground State,ES为Excited State。
恳请各位老师同学给予我一些解答,不胜感激~(我确实是最近脑子迷迷糊糊的了

,也学得有点不自信了)
作者Author: wzkchem5 时间: 2026-1-11 10:02
这种体系你确定TDDFT能算准?起码单点能得用NEVPT2吧
作者Author: Jayna 时间: 2026-1-11 11:37
王老师好,综合权衡计算量和精度目前的想法是该SET过程都在DFT/TDDFT下算,几何优化采用PBE1PBE/def2svp水平,单点能采用PBE1PBE/def2tzvp。计算资源挺紧张的,再加上面临毕业压力,确实也很难再提高精度了。
此外3a有机物有光异构化的过程是在CASSCF下计算的。
作者Author: Jayna 时间: 2026-1-11 11:38
王老师,还有一个问题详情请教您,为什么TDDFT会算不准呢?偏差会很大嘛?
作者Author: wzkchem5 时间: 2026-1-11 20:09
Fe配合物一般都有强相关,有的静态相关性质不是太强的,DFT有的泛函能算准,但难以事先知道是哪一个,比如有的B3LYP准而TPSSh不准,有的TPSSh准而B3LYP不准;静态相关性质稍强的,所有泛函都不够准,但CCSD(T)还可以;再强的,必须用多参考方法,如NEVPT2。CASSCF不要盲目相信,因为缺乏动态相关。
以上是针对基态,激发态更是重灾区,别的不说,单是一个自旋污染问题就导致一般程序的TDDFT结果都不可靠。参见https://mp.weixin.qq.com/s/er7-XOt0MfLrN_-5itZEwQ
作者Author: Jayna 时间: 2026-1-12 14:20
好的呢感谢王老师解答,我还有一个问题,针对SET过程我的计算思路和计算内容是对的吗?您有什么建议吗?
作者Author: wzkchem5 时间: 2026-1-13 08:56
可以。电子耦合尽量用多参考方法算
作者Author: Jayna 时间: 2026-1-13 14:50
好的呢,感谢王老师解答,老师还有什么博文或者帖子或者文献推荐阅读的嘛?
作者Author: wzkchem5 时间: 2026-1-13 16:11
在http://dx.doi.org/10.1021/acs.chemrev.8b00244里搜electronic coupling
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