计算化学公社

标题: gaussian计算六元碳环的开环TS正常结束但没有虚频 [打印本页]

作者
Author: 小荷月色 时间: 2026-1-11 17:52
标题: gaussian计算六元碳环的开环TS正常结束但没有虚频
如题我在计算一个反应过渡态，表现为六元碳环的开环，正常结束且观察到四指标全部正常收敛，但却没有虚频，这样的结果是不是代表我用TS的命令计算得到了一个极小值点，是不是需要改变初猜再进行一次尝试，请各位老师不吝赐教。

作者
Author: sgwzq 时间: 2026-1-11 18:25
是的，Gaussian给你优化到了一个你不想要的位置，应该重新算。如果再算不出来，可以考虑扫描势能面。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2026-1-11 18:33
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2026-1-11 20:49 编辑

这种为了研究煤炭燃烧/重整/吸附等反应而人为生造的，边缘一堆不饱和自由基/苯炔位点、强静态相关的活性石墨烯模型真的切合实际吗？
http://bbs.keinsci.com/thread-3808-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-17546-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-23390-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-43407-1-1.html
只贴几张截图漏掉了太多的信息，请打包压缩上传输入输出文件以便检查，用键线式等化学语言表达反应的原料与产物。

作者
Author: BinWang 时间: 2026-1-12 10:54
我看着你一开始的模型都建错了，有些地方该用H原子饱和的，没有饱和。这种东西极端不稳定。

作者
Author: 小荷月色 时间: 2026-1-12 15:42

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2026-1-11 18:33
这种为了研究煤炭燃烧/重整/吸附等反应而人为生造的，边缘一堆不饱和自由基/苯炔位点、强静态相关的活性石 ...

老师您好我传了我用于计算的前一步的中间态和过渡态计算的文件，阅读了您转发的链接中的帖子以后我想补充一点信息：我用的这个armchair结构是用于模拟煤焦燃烧反应计算的，所以边缘可能有不饱和的C原子。对于该步反应的猜测是六元环开环，单键断裂，产生的C-C=O键不稳定可以解离出CO

作者
Author: 小荷月色 时间: 2026-1-12 15:43

BinWang 发表于 2026-1-12 10:54
我看着你一开始的模型都建错了，有些地方该用H原子饱和的，没有饱和。这种东西极端不稳定。

您好我这个是用于燃烧反应的，不属于是强稳定态，所以可能会有不饱和C原子

作者
Author: BinWang 时间: 2026-1-12 16:31

小荷月色发表于 2026-1-12 15:43
您好我这个是用于燃烧反应的，不属于是强稳定态，所以可能会有不饱和C原子

燃烧反应猜测到这种中间体的话正常

作者
Author: BinWang 时间: 2026-1-12 16:32

小荷月色发表于 2026-1-12 15:43
您好我这个是用于燃烧反应的，不属于是强稳定态，所以可能会有不饱和C原子

用多参考态的方法看看

作者
Author: BinWang 时间: 2026-1-12 16:40

小荷月色发表于 2026-1-12 15:43
您好我这个是用于燃烧反应的，不属于是强稳定态，所以可能会有不饱和C原子

你这个体系不饱和C原子太多了，可能需要多参考态的计算，这个很麻烦。几个不饱和C原子连续排在苯环上，说明是非常不稳定的物种。

作者
Author: 小荷月色 时间: 2026-1-12 16:59

BinWang 发表于 2026-1-12 16:40
你这个体系不饱和C原子太多了，可能需要多参考态的计算，这个很麻烦。几个不饱和C原子连续排在苯环上，说 ...

这些不饱和C原子主要用于模拟反应活性位点，那如果把这些不参与反应的位点全部封闭了会不会相对稳定些，另外您说的这个多参考态计算可以进一步解释一下含义吗谢谢

作者
Author: BinWang 时间: 2026-1-12 18:36
本帖最后由 BinWang 于 2026-1-12 18:45 编辑

小荷月色发表于 2026-1-12 16:59
这些不饱和C原子主要用于模拟反应活性位点，那如果把这些不参与反应的位点全部封闭了会不会相对稳定些， ...

把活性位点用H封闭了当然会更加稳定，但封闭到什么程度，保留几个活性位点，这个问题只有干你们这行的人知道。至于多参考态计算可以搜索Sob老师的帖子例如http://bbs.keinsci.com/thread-2540-1-1.html，MOKIT程序能够做多参考态计算，可以搜一下。邹老师有相关的视频https://www.koushare.com/live/details/45931，https://www.koushare.com/live/details/45932. 实在消化不了就用开壳层的DFT简单计算吧。看看你们这一领域的人用什么泛函做的，沿用他们？

作者
Author: 小荷月色 时间: 2026-1-12 19:54

BinWang 发表于 2026-1-12 18:36
把活性位点用H封闭了当然会更加稳定，但封闭到什么程度，保留几个活性位点，这个问题只有干你们这行的人 ...

好的谢谢老师我去研究一下

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