计算化学公社

标题: 审稿求助：Dmol3程序能否实现基于M06-2X泛函的计算？算出的热力学数据可靠吗？ [打印本页]

作者
Author: JosephZhang 时间: 2026-1-12 17:29
标题: 审稿求助：Dmol3程序能否实现基于M06-2X泛函的计算？算出的热力学数据可靠吗？
本帖最后由 JosephZhang 于 2026-1-12 17:32 编辑

各位老师好！我最近审到了一篇一区top期刊的稿子，是用计算结果结合实验来说明某有机含溴产物（孤立体系，大约有30-40个原子）的分解路径，其中DFT计算采用M06-2X泛函，在Dmol3程序中计算，我个人过往进行的量子化学研究中从未使用过该程序，对其缺乏深入了解，但看到卢老师的相关帖子：为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序中提到该程序在杂化泛函中仅支持B3LYP，产生了一定困惑，想请教以下几个问题：
1.卢老师这篇帖子最后更新时间是23年，Dmol3近年来是否像ORCA、CP2K等程序有过重要更新，更新后支持M06-2X泛函开展计算呢？
2.作者还在本文中提到，结合DNP系列基组（我认为应该是一个2-zeta档次的基组？）对反应中间体及过渡态计算了高温下吉布斯自由能的相关数据，相比于使用Gaussian+Shermo计算的方法，在Dmol3中计算出的相关热力学数据可靠性如何，作差得到反应能垒后是否可能出现定性错误等问题呢？

作者
Author: UW_0728. 时间: 2026-1-12 18:26
本帖最后由 UW_0728. 于 2026-1-12 18:27 编辑

Dmol3没啥长进，还是比较烂，甭用；文章作者大概率也算得不咋明白

作者
Author: Hugo_314cat 时间: 2026-1-12 20:07
根据这篇文章【https://www.3ds.com/fileadmin/PR ... als-studio-2020.pdf】所述：

(, 下载次数 Times of downloads: 1)

可以回答第一个问题，也就是支持。
但我没用过也不屑于用，所以不对其可用性、准确性等做出评价。

作者
Author: JosephZhang 时间: 2026-1-12 21:18
感谢楼上两位老师的回复，关于能量计算准确性的问题我再结合其他资料调研一下。我个人也认同两位老师和卢老师的评价，在DFT计算中不会考虑使用该程序。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-1-13 00:11
最新版本有M06-2X，但速度远远慢于Gaussian，作者像是在苦海中。

DNP（2-zeta带极化函数）这种档次opt freq还行，拿来算热力学量的电子能量部分的话不太像话。如果是基组误差不至于导致定性错误、结论有问题的情况，比如一个反应过程放热很显著，差个5-10 kcal/mol都完全无所谓，并且文章不是以计算为重点的话，放他一马也凑合；但如果本来反应能的大小就不大，误差都可能影响结论、结果的符号，或者要根据势垒算反应速率常数、根据不同结构的相对自由能算Boltzmann分布这种事，以及算弱相互作用能，都对能量误差很敏感，DNP的基组不完备性误差就不可接受了，非要用Dmol3的话怎么也应该用TNP（三分裂价并带有较多极化函数）。

作者
Author: aaq2800 时间: 2026-1-13 08:35
较新版本的Dmol3有M06-2X

作者
Author: JosephZhang 时间: 2026-1-13 18:28

aaq2800 发表于 2026-1-13 08:35
较新版本的Dmol3有M06-2X

好的谢谢

作者
Author: JosephZhang 时间: 2026-1-13 18:30

sobereva 发表于 2026-1-13 00:11
最新版本有M06-2X，但速度远远慢于Gaussian，作者像是在苦海中。

DNP（2-zeta带极化函数）这种档次opt f ...

明白了，感谢卢老师的详细解答！

作者
Author: zhengyue 时间: 2026-1-13 18:52
如果是理论佐证实验，趋势对了，能放一马就放一马吧

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