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标题: 求助中性反应路径和阴离子反应路径能垒的对比 [打印本页]

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jw227    时间: 2026-1-14 17:57
标题: 求助中性反应路径和阴离子反应路径能垒的对比
1,请问,中性反应和阴离子两种反应路线对比,是阴离子加弥散就可以,还是要统一都加弥散

2,请问,阴离子在二氯甲烷里反应,有钠离子,如果统一不加弥散,隐式溶剂,可以放一个钠离子在阴离子旁算反应吗,这样似乎钠离子结合很紧(应该是分别被二氯甲烷包裹才是真实的吧),但又不想用显式溶剂,可以吗

3,几何优化加弥散,单点用大基组,不加弥散可以吗

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Hugo_314cat    时间: 2026-1-14 18:15
1. 如果是我我会统一以消除任何可能的系统误差。
2. 个人认为只要有原子有强的负电荷(尽管体系整体可能不带电)就应当最起码给那个原子加弥散。
3. 这个体系能让你连几何优化都原意加弥散,那为何单点反而不愿意加弥散了呢?一个良选择是保持至少同等弥散下选择更大的基组。
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jw227    时间: 2026-1-14 21:20
总觉得中性体系加弥散会过拟合
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sgwzq    时间: 2026-1-14 22:32
jw227 发表于 2026-1-14 21:20
总觉得中性体系加弥散会过拟合

阴离子强烈建议加,我自己的过渡态死活优化不出来,后来发现是没加弥散导致的。
至于中性的反应,想要和它比较肯定也得在同一个级别。一个带弥散一个不带不公平(据我测试会有几kcal/mol的误差)
几何优化中性不用加弥散,阴离子该加加,振动分析也是。阴离子只要给显著带负电性的部分加就行。
到计算电子能量的时候,统一用一个带弥散函数的大基组才公平。


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sobereva    时间: 2026-1-15 01:30
jw227 发表于 2026-1-14 21:20
总觉得中性体系加弥散会过拟合

纯粹是想多了,哪来的什么过拟合。顶多是耗时上(往往无意义地)浪费、SCF往往更难收敛、更容易基函数有线性依赖问题而已(但并不会因为是中性分子就导致比阴离子更容易有线性依赖问题。线性依赖问题纯粹是基函数层面的,与体系无关),以及下文提到的其它零七八碎的问题
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119


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Huschein    时间: 6 day ago
对于DFT来说 显式溶剂建模可能比较困难 但是对于MLFF来说完全不是问题 MAPLE内置了接近100种平衡态的显式溶剂box(包含二氯甲烷) 你可以根据你的所想设置box大小 调控显式溶剂范围 轻易的实现显示溶剂建模,在MAPLE原文中就计算了DA反应在不同的显式溶剂下的势能面(https://chemrxiv.org/engage/chem ... 9bbafb3b11118e9807e),扫描51*51=2601的势能面 体系600原子 只需要半天不到的时间

http://bbs.keinsci.com/thread-57731-1-1.html




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