计算化学公社

标题: 关于MMPBSA参数文件设置新人求助，关于力场部分该如何书写 [打印本页]

作者
Author: 科研小白0126 时间: 2026-1-14 18:51
标题: 关于MMPBSA参数文件设置新人求助，关于力场部分该如何书写
各位老师我的给体和受体都是GAFF，那我在mmpbsa.in文件下关于力场部分该如何书写，
1.  forcefields       = "leaprc.gaff/forcefields"

2.  forcefields       = "leaprc.gaff/leaprc.gaff"
3.  forcefields       = "leaprc.gaff"
4.  forcefields       = "leaprc.gaff,leaprc.gaff"
这里的leaprc是MMPBSA读体系所调用对应力场的脚本的意思吗，是必须得写的吗，想请教一下各位老师上面哪个是正确的，我使用sobtop构建的itp，里面有的二面角是guess (same as GAFF X -X -ca-ha)GAFF力场下的

作者
Author: student0618 时间: 2026-1-14 19:45
很多不同的MMPBSA for GROMACS版本，先说是哪个？ gmx_MMPBSA?

作者
Author: 科研小白0126 时间: 2026-1-15 09:35

student0618 发表于 2026-1-14 19:45
很多不同的MMPBSA for GROMACS版本，先说是哪个？ gmx_MMPBSA?

gmx_MMPBSA

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)