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标题: 求助：关于探针半径的疑问 [打印本页]

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Author: Lisy 时间: 6 day ago
标题: 求助：关于探针半径的疑问
请问我在用Multiwfn计算孔尺寸的时候，这里设置的1.8可以认为就是类似参考文献的说法，我们是采用1.8埃的范德华半径作为探针球来计算获得孔径和孔自由体积吗

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Author: pal 时间: 5 day ago
一个是1.8埃，一个是原子范德华半径（不同原子不同）的1.8倍，为啥认为是一样的

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Author: Lisy 时间: 5 day ago

pal 发表于 2026-1-19 09:03
一个是1.8埃，一个是原子范德华半径（不同原子不同）的1.8倍，为啥认为是一样的

谢谢您，那请问这个探针球的尺寸一直在变是吗，因为体系不同原子的范德华半径不一样

作者
Author: sobereva 时间: 5 day ago

Lisy 发表于 2026-1-19 10:34
谢谢您，那请问这个探针球的尺寸一直在变是吗，因为体系不同原子的范德华半径不一样

认真把下文第3节的原理介绍部分看了，自然就知道是什么意思
使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539（http://bbs.keinsci.com/thread-16491-1-1.html）

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