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标题: 请问过渡态对应的反应复合物一定存在吗 [打印本页]

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一条君    时间: 3 day ago
标题: 请问过渡态对应的反应复合物一定存在吗
本帖最后由 一条君 于 2026-1-22 16:40 编辑

分子A与自由基离子B的反应,考虑了隐式溶剂效应,找到了过渡态,但是找反应复合物的时候,把两个放到一起优化,关键词就是opt,直接得到了产物,
(1)请问是哪里错了还是不存在反应复合物呢

(2)如果不存在反应复合物,那么自由能能垒是不是就变成G(TS)-[G(A))+G(B)]了,谢谢老师们

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自问自答:把两个放到一起优化,直接得到了产物,是因为摆放位置太近导致的(摆放远的也试了一下,是scf不收敛,所以摆放位置很重要)
用跑完IRC的首端结构再去优化,可以得到反应复合物


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BinWang    时间: 3 day ago
过渡态能垒太小了,所以多找几个构型,挑出没有H转移的摆上去就行。反正是能反应的。
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超速的蜗牛    时间: 3 day ago
自由能能垒本来就是G(TS)-[G(A))+G(B)]吧
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一条君    时间: 3 day ago
超速的蜗牛 发表于 2026-1-20 09:56
自由能能垒本来就是G(TS)-[G(A))+G(B)]吧

社长讲的基元反应的能垒应该是TS-反应复合物的,G(TS)-[G(A--B)],网站上应该有很多讨论
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一条君    时间: 3 day ago
本帖最后由 一条君 于 2026-1-20 11:18 编辑
BinWang 发表于 2026-1-20 09:51
过渡态能垒太小了,所以多找几个构型,挑出没有H转移的摆上去就行。反正是能反应的。

不知道这样理论上严谨吗?不知道跑完IRC取反应端,优化后会不会还是得到产物,所以先来公社问一下(自己还没有irc的经验)
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BinWang    时间: 3 day ago
一条君 发表于 2026-1-20 11:16
不知道这样理论上严谨吗?不知道跑完IRC取反应端,优化后会不会还是得到产物,所以先来公社问一下(自己 ...

你如何定义存在?就算是摆出不同构型,有些能量高,那也是存在的,只是寿命短。当前的反应很容易进行,没有必要纠结了
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KazusaT    时间: 3 day ago
超速的蜗牛 发表于 2026-1-20 09:56
自由能能垒本来就是G(TS)-[G(A))+G(B)]吧

如果你考虑基元反应,实际上A+B to A...B也是一步,所以氢转移那一步应该是TS-(A...B)
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wzkchem5    时间: 3 day ago
如果TS已经找到了且是正确的,那么从TS走IRC应当可以得到正确的反应复合物。如果IRC结果不正确,那么说明你找的TS就是错的




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