计算化学公社

标题: 请教各位老师计算NICS(1)zz的时候如何快速获取所有Bq原子的坐标 [打印本页]

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Fencros7y    时间: yesterday 15:58
标题: 请教各位老师计算NICS(1)zz的时候如何快速获取所有Bq原子的坐标
各位老师好,最近希望对比一批芳环分子的NICS(1)zz数值,由于分子数量比较多且每个分子内的苯环数量也比较多,请问各位老师如何快速得到所有的Bq原子坐标呢(所有原子均共平面,Bq原子均为六元环的中心上方1a)?

我搜索的时候发现了sob老师写的《使用Multiwfn巨方便地绘制二维NICS平面图考察芳香性》,这种方法固然可以,不过我还是希望知道有没有快速获取所有六元环中心Bq原子坐标的方法 :)
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UW_0728.    时间: yesterday 16:00
我感觉那个博文里介绍的方法已经足够方便了
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yaonaite    时间: yesterday 16:03
本帖最后由 yaonaite 于 2026-1-22 16:04 编辑

这个是我写的一个小工具,不过会把上下的Bq都搞出来,可以试着用用
pyforNICS:基于python和multiwfn的NICS(1)ZZ建模和计算工具
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 54468&fromuid=69152
(出处: 计算化学公社)

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Fencros7y    时间: yesterday 16:14
yaonaite 发表于 2026-1-22 16:03
这个是我写的一个小工具,不过会把上下的Bq都搞出来,可以试着用用
pyforNICS:基于python和multiwfn的NIC ...

感谢分享,我试试看
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wangzhe    时间: 4 hour ago
https://wongzit.github.io/program/pyaroma/
支持一键为所有环添加Bq原子
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Author:
Fencros7y    时间: 3 hour ago
wangzhe 发表于 2026-1-23 10:30
https://wongzit.github.io/program/pyaroma/
支持一键为所有环添加Bq原子

完美,感谢老师!如果后面有机会发文章的话我会引用您的文章
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Fencros7y    时间: 10 min ago
wangzhe 发表于 2026-1-23 10:30
https://wongzit.github.io/program/pyaroma/
支持一键为所有环添加Bq原子

王老师,我想请教一下,我的结构都是纯平面分子,您的软件可以只给平面的同一侧加上Bq原子吗,两侧都加是否会影响计算量呢?




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