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标题: 请问一下铂和硅组成的janus颗粒,在gromacs里用什么力场比较合适? [打印本页]

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小趴菜学gromacs    时间: yesterday 16:04
标题: 请问一下铂和硅组成的janus颗粒,在gromacs里用什么力场比较合适?
各位老师你们好,我建立一个janus颗粒,直径一纳米,一半由硅组成,一半由铂组成,现在想做这个janus颗粒过一个石墨烯孔的模拟(颗粒如下图)
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我想请问一下,对于这样的Janus颗粒的模拟,该采用什么力场?

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sobereva    时间: yesterday 19:31
Pt用J. Phys. Chem. C, 112, 17281 (2008)的LJ参数,C用GAFF的LJ参数,原子电荷用CHELPG或MK(建议Multiwfn计算时把拟合点设得密一些)。并且在sobtop产生其拓扑文件的时候对C-C和C-Pt加上bond和angle项(用猜的力常数)维持刚性。
作者
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小趴菜学gromacs    时间: yesterday 21:41
sobereva 发表于 2026-1-22 19:31
Pt用J. Phys. Chem. C, 112, 17281 (2008)的LJ参数,C用GAFF的LJ参数,原子电荷用CHELPG或MK(建议Multiwfn ...

感谢老师的回复,就是我的janus颗粒还有一半是硅元素,硅用的力场和铂用的力场会不会冲突呀




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