计算化学公社

标题: D+A-组成的波函数查看自旋密度图 [打印本页]

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赵云跳槽    时间: 2017-5-8 20:09
标题: D+A-组成的波函数查看自旋密度图
使用Qchem计算D+和A-的束缚能,使用片段局域方法,但可惜的是产生的波函数文件只是最后一个片段的波函数文件
没办法,计算两次,分别得到了D+的波函数,和A-的波函数文件

现在使用Multiwfn将其组合成一个文件,使用波函数运算符号“+”,然后做自旋密度图
Multiwfn的依次操作为
D+.fchk
5
0  // 运算
1  
+,A-.fchk
2   //格点选择
5  // 自旋密度图
2  // 导出cube文件,放到VMD中作图

原理上,由于两个分子都带有电荷,那么得到的自旋密度图应该呈现alpha电子在D上,beta电子在A上
但现在显示的自旋密度图就只有alpha电子,没有beta电子
这个有什么好的办法?
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左边是单独展示的效果,右边是电子密度相加后的效果,实际上我想把右边的那个水分子变成蓝色



作者
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sobereva    时间: 2017-5-8 21:10
把运算符从+改成-就行了
作者
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赵云跳槽    时间: 2017-5-8 22:26
sobereva 发表于 2017-5-8 21:10
把运算符从+改成-就行了

还真可以,太有喜感了
(, 下载次数 Times of downloads: 29)

作者
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alonewolfyang    时间: 2017-5-9 11:03
减号是神么意思

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赵云跳槽    时间: 2017-5-9 11:07
alonewolfyang 发表于 2017-5-9 11:03
减号是神么意思

D+的波函数 加上 负的A-的波函数,这样就能够看到轨道的不同自旋方向了
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冰释之川    时间: 2017-5-9 11:30
赵云跳槽 发表于 2017-5-9 11:07
D+的波函数 加上 负的A-的波函数,这样就能够看到轨道的不同自旋方向了

我怎么感觉 “负的A-的波函数”代表在A-的波函数里alpha自旋与beta自旋人为发生反转从而体现beta>alpha,也许默认的自旋都是alpha>beta导致做的自旋密度清一色的只看到alpha?
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-5-9 12:47
赵云跳槽 发表于 2017-5-9 11:07
D+的波函数 加上 负的A-的波函数,这样就能够看到轨道的不同自旋方向了


应当是 D+的波函数对应的自旋密度 减去 D-波函数对应的自旋密度
不是波函数直接的加减

量化程序输出的波函数里,都是令alph电子a>=beta电子,所以当前必须做减法,才能令D-体系beta电子和alpha电子调换,使其beta电子>=alpha电子
作者
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赵云跳槽    时间: 2017-5-10 00:02
谢谢两位的讨论和回答





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