计算化学公社
标题:
我想用Gaussian做个bomd,各位老师,同学能帮我看看吗?
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作者Author:
蒲昊贤
时间:
yesterday 14:18
标题:
我想用Gaussian做个bomd,各位老师,同学能帮我看看吗?
各位老师同学好,我做吸附氢分子,想看它在300k能不能释放,77k稳不稳定
我的gif文件开头是
%nprocshared=16
%mem=2000MB
#p wb97xd/6-31++g(2d,2p) nosymm
bomd=(update=5,maxpoints=10000,stepsize=10000,rtemp=300,readstop)
我的问题是
Maxpoints=10000 每个轨迹的最大步数
Stepsize=10000 是 10000*0.0001=1fs 相当于 步长为1fs
总的就是10000fs =10 ps
RTemp=300这个就是温度300k
ReadStop 读入另外的停止标准(
我这个后面没有跟什么内容,是不是跑到最大步数就停止了呀?或者是我直接不加)
update=5 BOMD默认在每一个点进行二阶求导,使用Update关键词会使程序在计算新的Hessian之前,在n个梯度点上更新hessian。GradientOnly定义只做梯度计算,并且总是更新hessian(不计算完全的二阶微分)。ReCalcFC是该选项的同义词,
我不太明白这个
NTraj=N 计算N个轨迹 我这个没有是不是不加也没有关系呢?
算出log文件是不是在log中 例如Predicted information for step 19415
这个地方去找每步的能量
作者Author:
sobereva
时间:
yesterday 14:55
除非你要做准经典动力学,否则建议用ORCA做MD,明显易用,看
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576
(
http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html
)
PS:Gaussian、ORCA、xtb做动力学的方法在北京科音高级量子化学培训班(
http://www.keinsci.com/KAQC
)里有极为全面系统、掰开了揉碎了的讲授,如果学一遍在AIMD方面就精通了,并且你问的这些问题也就一次性全都明白了
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