计算化学公社

标题: 请教1000ns后蛋白金属体系是否平衡 [打印本页]

作者
Author: YuniJ 时间: 2026-1-26 11:16
标题: 请教1000ns后蛋白金属体系是否平衡
如图所示，横坐标是800-1000ns，纵坐标分别是三个指标：蛋白质RMSD、蛋白质Rg、蛋白质内部氢键，请问第一个体系和第二个体系收敛了吗？第一个体系RMSD最后有上升的趋势，但是Rg和内部氢键收敛了，这个体系可以认为是收敛的吗？

作者
Author: student0618 时间: 2026-1-27 15:51
要看体系及目的，不能一概而论。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-1-28 16:55
参考
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627（http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html）

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