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标题: NRT看不到结果 [打印本页]

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-9 15:55
标题: NRT看不到结果
新手求助，为什么做NRT是时候没有NRT的结果？在结尾也有写关键词$nbo nrt $end
谢谢各方大神了

作者
Author: beefly 时间: 2017-5-9 18:58
到输出文件去找：

NATURAL RESONANCE THEORY ANALYSIS:

Maximum reference structures : 20
Maximum resonance structures : 300
Memory requirements : 5924646746575 words of 99884659 available

TOPSTR: too many structures; consider setting NRTRES > 300 and/or NRTCHG < 1

作者
Author: Jasminer 时间: 2017-5-10 20:00
一眼看过去是NTR没有结果。。。捂脸遁

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-11 11:25

beefly 发表于 2017-5-9 18:58
到输出文件去找：

NATURAL RESONANCE THEORY ANALYSIS:

我想看共振式，可是好像看不到，我做另一个结构是能看到共振式的耶。这是怎么回事呢？

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-11 11:27
为什么这个文件可以明显看出几个共振式，而2.NRT却找不到呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-5-11 14:27

qiongxie 发表于 2017-5-11 11:27
为什么这个文件可以明显看出几个共振式，而2.NRT却找不到呢？

提示已经很清楚了，当前NRT分析失败，需要改参数

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-11 21:11

sobereva 发表于 2017-5-11 14:27
提示已经很清楚了，当前NRT分析失败，需要改参数

请教如何修改呢？我试了在第一行和最后一行加关键词都不行耶。
#T GFINPUT IOP(6/7=3) B3LYP/6-31G* pop=nbo6read NRTRES>300

3phenol

1 1
坐标

$nbo nrt $end
或者（NRTRES>300）都不行。
请问问题出在哪里呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-5-11 23:47

qiongxie 发表于 2017-5-11 21:11
请教如何修改呢？我试了在第一行和最后一行加关键词都不行耶。
#T GFINPUT IOP(6/7=3) B3LYP/6-31G* pop ...

提示里让你加的关键词是加在$NBO和$END之间

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-18 17:41
好的，谢谢老师

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-31 16:59

sobereva 发表于 2017-5-11 23:47
提示里让你加的关键词是加在$NBO和$END之间

老师，我试了$nbo NRTRES > 300 $end 和NRTCHG < 1 还有$nbo NRTRES > 300 and/or NRTCHG < 1 $end这几种方法都看不到共振式。依旧提示
Maximum reference structures : 20
Maximum resonance structures : 300
Memory requirements : 5924646746575 words of 99884659 available

TOPSTR: too many structures; consider setting NRTRES > 300 and/or NRTCHG < 1
这种时候该怎么处理呢？谢谢老师了

作者
Author: sobereva 时间: 2017-5-31 17:20
指的是写上NRTRES=x NRTCHG=y，这里x是一个大于300的值，y是小于1的值，不是让你直接写诸如NRTRES > 300

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-5-31 21:01

sobereva 发表于 2017-5-31 17:20
指的是写上NRTRES=x NRTCHG=y，这里x是一个大于300的值，y是小于1的值，不是让你直接写诸如NRTRES > 300

嗯嗯，谢谢老师。不好意思，没有看清楚，谢谢老师了

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-6-1 18:14

sobereva 发表于 2017-5-31 17:20
指的是写上NRTRES=x NRTCHG=y，这里x是一个大于300的值，y是小于1的值，不是让你直接写诸如NRTRES > 300

老师，当出现上述提示$NRTSTR 后，我设置NRTRES=400 NRTCHG=0 后又出现如下提示：
NRT was unable to identify any acceptable reference structures.
Try specifying reference structures using the $NRTSTR keylist.
这种情况下怎么用$NRTSTR 指定参考结构呢？谢谢老师了。

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-6-1 18:15
这个是出现上述问题的com 和log

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-1 18:35

qiongxie 发表于 2017-6-1 18:15
这个是出现上述问题的com 和log

NBO6手册里搜NRTSTR

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-6-5 16:13
本帖最后由 qiongxie 于 2017-6-5 16:25 编辑

sobereva 发表于 2017-6-1 18:35
NBO6手册里搜NRTSTR

老师，我按照手册里先预先设定了一种可能结构，可是还是算不出来？
$nbo nrt  $end
$NRTSTR
  STR
LONE 18 1 19 1 END
BOND D 1 2 S 1 6 S 1 18 S 2 3 S 2 8 S 3 4 S 3 9 D 4 5 S 4 10 S 5 6 S 5 11
      S 1 2 D 2 3 S 3 4 D 4 5 S 5 6 D 1 6 D 3 9 S 9 13 D 13 12 S 12 10 D 10 4
      S 2 8 S 7 9 S 13 16 S 12 15 S 10 14 S 5 11 S 1 18 S 6 17 S 18 19 D 17 19
      S 18 24 S 17 20 S 20 21 S 20 22 S 20 23 S 24 25 S 24 26 S 24 27
  END  END
$END
又出现如下提示： Structure 1 of the $NRTSTR keylist has 1 too many electron pair(s)是因为预设的结构不合理么？

作者
Author: qiongxie 时间: 2017-6-16 15:47
$NRTSTR
  STR
LONE 18 1 19 1 END
BOND D 1 2 S 1 6 S 1 18 S 2 3 S 2 8 S 3 4 S 3 9 D 4 5 S 4 10 S 5 6 S 5 11
      S 1 2 D 2 3 S 3 4 D 4 5 S 5 6 D 1 6 D 3 9 S 9 13 D 13 12 S 12 10 D 10 4
      S 2 8 S 7 9 S 13 16 S 12 15 S 10 14 S 5 11 S 1 18 S 6 17 S 18 19 D 17 19
      S 18 24 S 17 20 S 20 21 S 20 22 S 20 23 S 24 25 S 24 26 S 24 27
  END
  END
$END
老师，我设置了上述的可能性，但是出现如下结果该如何解决呢？
Structure 1 of the $NRTSTR keylist has 2 too few electron pair(s)

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-17 17:10

qiongxie 发表于 2017-6-16 15:47
$NRTSTR
STR
LONE 18 1 19 1 END

不如直接写信问开发者

作者
Author: drkiwi 时间: 2017-6-20 03:52

qiongxie 发表于 2017-6-1 18:15
这个是出现上述问题的com 和log

Sorry for replying in English. I don't know Chinese!
You'd better to limit the resonance system via <> after $NRT keyword. for your case, it should be like that:
$NRT <1 2 3 4 5 6 9 10 12 13 17 18 19> NRTRES=2000 NRTREF=300 $END
in which, NRT just analyses the resonancy for atoms mentioned in <>. hope it helps.

作者
Author: qiongxie 时间: 2018-1-2 12:02

drkiwi 发表于 2017-6-20 03:52
Sorry for replying in English. I don't know Chinese!
You'd better to limit the resonance system v ...

thanks

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