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标题: 高斯软件并行效率实测与购机建议，还有一些胡言乱语 [打印本页]

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-6 12:59
标题: 高斯软件并行效率实测与购机建议，还有一些胡言乱语
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-1-6 14:16 编辑

郑重声明：本总结是基于楼主本人的知识以及真实测试结果而做的。本人与intel的关系仅限于“买了一些intel的cpu并长期使用它们”。本人与Gaussian的关系仅限于“买了高斯的版权并长期使用它”。我不是intel或Gaussian的托！

这篇胡言乱语主要包含以下内容：
（一）高斯的多核心并行效率真不咋地
（二）虽然少核心高主频的CPU确实很贵，但是它们就是偏偏适合高斯计算
（三）买电脑，砍价一定要腰斩
（四）能自己攒的机器，就要自己攒！不要买品牌机

好了，开始！

（一）高斯的并行效率

测试机器：两片E5-2680v2处理器，64G内存，普通SAS硬盘，整个机器是按照DDRIII-1600配起来的，关掉超线程后，共20个计算核心。
系统为Centos 6.4 X64。软件为Gaussian 09 D.01 ES64L

测试题：
一个已经用cam-b3lyp优化好的200多个原子的体系，有氢氧硫碳氮碘锌。基组为6-31G(d)和LanL2DZ混用。现在拿着这个构型在同等水平下，进行单点能计算，很幸运的，每次测试的SCF cycle都是13次。

测试结果：

(, 下载次数 Times of downloads: 185)

图1 高斯实测并行效率

当使用12核心并行的时候，总CPU时间为33分36秒，平均每核心运行时间2分48秒
当使用20核心并行的时候，总CPU时间为43分32秒，平均每核心运行时间2分11秒

我们绘制图1，得到以下结论
（1）高斯的2核并行效率很好，4核并行效率也说得过去，8核并行效率就有些难看了。再往上加核心数，并行效率惨不忍睹。
（2）8核心并行，任务运行205秒后结束。而16核心并行，任务运行144秒后结束。多加了一倍的核心数，计算时间仅仅减少了三成儿。
（3）6核心并行，任务运行285秒后结束。而16核心并行，任务运行144秒后结束。为了减少一半的计算时间，我们付出了2.6倍的CPU核心数。
（4）2核并行效率高达95%，12核心并行效率已经降至51%，而20核并行效率更是低达38%。

总结论：高斯的并行效率真心不咋地！超过8核心并行的话，意义已经不大了。我建议极限最多并行核心数不要超过12。

（二）虽然少核心高主频的CPU确实很贵，但是它们就是偏偏适合高斯计算

少核心高主频的CPU确实很贵，我们用理论计算常用的E5-2600v2系列来对比一下，一个是大众化的多核心正常主频的E5-2650v2，一个是小众化的少核心高主频的E5-2643v2，一个是很少有人知道的少核心高主频的E5-2637v2：
（1）E5-2650v2，每颗CPU为八核心，20M缓存，处理器基本频率为2.6GHz，最大睿频3.4GHz，这样总基本频率为20.8GHz，总睿频可达到27.2GHz，热设计功耗功率也仅仅只有95W，每颗CPU出厂价为1171美元
（2）E5-2643v2，每颗CPU为六核心，25M缓存，处理器基本频率为为3.5GHz，最大睿频3.8GHz，这样总基本频率为21.0GHz，但是总睿频仅仅达到22.8GHz，热设计功耗居然高达130W，每颗CPU出厂价也达到了瞠目结舌的1552美元
（3）E5-2637v2，每颗CPU为四核心，15M缓存，处理器基本频率为为3.5GHz，最大睿频3.8GHz，这样总基本频率为14.0GHz，但是总睿频仅仅达到15.2GHz，热设计功耗也是高达130W，每颗CPU出厂价也竟然也达到了996美元
考虑到高斯糟糕的并行效率，我宁可选择2号或3号，而不选择1号。换句话说，高斯糟糕的并行效率逼迫我做出了很浪费钱的一个决定。同时，考虑到高斯糟糕的并行效率，我觉得双路主板对咱们来说真是够了！

（三）买电脑，砍价一定要腰斩

我便抱着自己的测试结果去买电脑，想买以下电脑配置。
一个2U的四子星，内含4个节点，每个节点内有2颗E5-2643v2的CPU，8条8G的ECC内存，千兆网卡，预留infiniband接口（只是预留而已，为了以后方便，现在用不着）。四个节点公用一个电源模块，公用一个冗余电源模块。四个节点公用一个硬盘盒，盒内有4块1T的sas硬盘。
这货就长这样：

(, 下载次数 Times of downloads: 193)

图2 四子星（2U）结构

我先联系曙光，曙光报价18万，我让他们滚一边儿去！
然后联系华硕，华硕报价16万多不到17万，我没说啥，心中默默给他们画了个叉。
然后联系越海扬波，越海杨波报价12万。我心动了！
我早就给他们合算了成本了，如果我按照市场价自己买散件自己攒机，那么总价格为12万7千多。考虑到各大服务器公司都有自己的进货渠道，这台机器让他们攒，纯硬件成本绝对不多于10万零5千。
曙光报价18万，我虽不齿，却也理解。曙光公司有很高大的金字塔架构。底层一千个销售员，要养活上中层八百个坐办公室的！一套设备，他们没赚到足够的钱就相当于赔本了。
而我需要的就是一个攒机商。我只需要硬件质保。从系统到软件，我完全不需要对方服务。
最后我还是没要越海扬波的机器，我要了另一家更小的公司的机器。价格仅有11万稍出头而已，我估计对方从这单生意中赚走我的钱不超过6000块。但是我这儿不能公布那家公司的名字，因为我不是他们的托。嘿嘿

（四）能自己攒的机器，就要自己攒！不要买品牌机

我实际上已经花掉了20多万，为自己和三位研究生买了两台四子星，也就是8个双路节点了。再加上我师兄出国前留给我8个老的双路节点，嗯，机器一时间富裕起来，我便开始动了花花肠子，看着自己的办公用的主机箱越来越不顺眼。而且我的主机箱里边儿，现在已经是老牛破车哐当当了。究其原因，全是因为我用它用的太狠。这台主机，内有俩系统。三年来，它白天开着win给我当办公电脑，晚上临走我就换到linux下给它挂个小任务让它算着，第二天早上我来收庄稼。现在这台主机箱那是动辄死机啊。我就想换掉它。
老规矩，攒机！
既然主要用途是白天开win给我办公用，夜里开linux为我算小任务，那么，就限制在LGA1150接口的CPU好了，不必追求LGA2011接口既然白天要开win，那么一定要用的爽，不爽不就白瞎了么。慎重思考后，如下：

华硕（ASUS）B85M-E 主板(Intel B85/LGA 1150)
英特尔（Intel）酷睿四核i7-4770k Haswell全新架构盒装CPU（LGA1150/3.5GHz/8M三级缓存/84W/22纳米）
（主板和CPU套装价格为2608元）
华硕（ASUS） R9270X-DC2T-4GD5 1120MHz/5600MHz 4GB/256bit DDR5 PCI-E 3.0 显卡 1499元
金士顿(Kingston)骇客神条 Fury系列 DDR3 1600 16GB(8GBx2条)台式机内存(HX316C10FK2/16)蓝色 1099元
两块金士顿(Kingston)V300 240GB SATA3 固态硬盘 699元*2
西部数据(WD)绿盘 2TB SATA6Gb/s 64M 台式机硬盘(WD20EZRX) 529元
酷冷至尊(CoolerMaster)V650S额定650W电源(80PLUS金牌/半模组/静音/主动式PFC/支持背线/质保5年) 649元
酷冷至尊(CoolerMaster)毁灭者经典U3升级版游戏机箱(ATX/USB3.0/背走线/电源下置/支持SSD/LED风扇)黑色 199元
三星（SAMSUNG） SH-224DB 24速串口 DVD刻录机（黑色）106元
总额8087元

说干就干了，买来硬件，插了机器，然后在两个固态硬盘上，分别装win7系统和ubuntu14.10系统，机械硬盘给我分成两个1T的分区，分别搞成ntfs格式给win7，和ext4格式给ubuntu用。
说实话这台机器都快顶上一台小服务器了啊……把超线程一关，4x3.5GHz的CPU，16G的内存，2T的机械硬盘……我师兄早年买的服务器也不过如此！这儿插一句：如果把上述配置中的显卡省略掉，那么，还剩下不到6600块钱的配置。把这六千多块钱的硬件一攒，你就已经获得了一台Linux操作系统及计算化学软件与编程的学习用机了（玩票用）
这货就长这样：

(, 下载次数 Times of downloads: 199)

图3 酷冷至尊毁灭者经典U3升级版游戏机箱

童鞋，跑个分儿呗？
处理器和内存都接近满分，硬盘和显卡直接就是满分，嗯，玩模拟城市，终于可以把特效全开了！
实际上这个机器的配置已经远远超过了win7测评的范围了。它之所以给出满分纯粹是因为没有更高分可给了。

(, 下载次数 Times of downloads: 208)

八千块啊，如果买品牌机，我敢保证顶多达到我这个机器一半的配置就算销售商有良心了。所以，即使在今天，攒机也是王道！

作者
Author: ChaosChiao 时间: 2015-1-6 14:22
关键是很多科研部门不能自己攒机，必须要走央采。

作者
Author: lao7 时间: 2015-1-6 14:31
本帖最后由 lao7 于 2015-1-6 14:35 编辑

楼主帮我看看这个配置，运行gaussian浪费不？
CPU:E5-2667 V3 3.2G 8核16线程 *9000
散热器：采融B68 Basic 68 8热管纯铜镀镍  199×2
主板：超微X10DRL-I 带集显 C610芯片组X99 2499×1
内存：三星 DDR4 2133 16G单根*5200
硬盘：英睿达(Crucial)MX100系列 512G CT512MX100SSD1  1569元
电源：昂达服务器电源 650W                      500元
机箱：安钛克（Antec） GX900 229
配下来将近2万元

还有，按照楼主的思路，是不是CPU 换成E5 2643 v3  3.4主频的  双路12核心是不是效率更高？

作者
Author: wgbigfatcat 时间: 2015-1-6 14:33
怎么不用i7-4770k 开测一下同样的gaussian？

作者
Author: lao7 时间: 2015-1-6 14:38
本帖最后由 lao7 于 2015-1-6 14:40 编辑

wgbigfatcat 发表于 2015-1-6 14:33
怎么不用i7-4770k 开测一下同样的gaussian？

担心体系大了跑不动哈，240个原子，加上频率计算，跑到猴年马月，估计内存都要升级。

楼主认为：E5-2667 v3 3.2G 8核心 E5 2643 v3 3.4G 6核心如果都双路的情况下，计算大100-250个原子原有的分子，哪个更快些？给个意见，正好现在在配机器。自己动手！采购太黑

作者
Author: wgbigfatcat 时间: 2015-1-6 14:41
E5-2680 v3 个人认为这个性价比高。前提是不一定全跑gaussian

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-6 14:42
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-1-6 14:48 编辑

lao7 发表于 2015-1-6 14:31
楼主帮我看看这个配置，运行gaussian浪费不？
CPU:E5-2667 V3 3.2G 8核16线程 *9000
散热器：采融B68 B ...

倒是真说不上浪费，比玩票强一些，比正经干活儿却又弱一些，算是高级票友吧，算着玩玩儿罢了。
但是，你只买一颗E5-2667？你们家的CPU会哭着喊着要媳妇儿！再说，这张主板也是双人床哈！
我建议你关注一下E5-1680v3可好？这款是独行侠型服务器用CPU中性能很高的一款了

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-6 14:44

wgbigfatcat 发表于 2015-1-6 14:33
怎么不用i7-4770k 开测一下同样的gaussian？

i7跟e5对比测试……额……我还真没对比过……但是很难比……毕竟服务器里面的内存是ecc的，服务器里面的硬盘是sas的，服务器里的主板是双路的，……不一样的东西太多，比了也没太大意义吧

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-6 14:45

lao7 发表于 2015-1-6 14:38
担心体系大了跑不动哈，240个原子，加上频率计算，跑到猴年马月，估计内存都要升级。

楼主认为 ...

很难说，
前者稍快一点儿，我有七成把握

作者
Author: lao7 时间: 2015-1-6 14:49

yjcmwgk 发表于 2015-1-6 14:42
倒是真说不上浪费，比玩票强一些，比正经干活儿却又弱一些，算是高级票友吧，算着玩玩儿罢了。
但是，你 ...

这主板双路，不是单路

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-6 15:04
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-1-6 16:49 编辑

lao7 发表于 2015-1-6 14:49
这主板双路，不是单路

哎呀对不起对不起
但是，你只买一颗E5-2667？你们家的CPU会哭着喊着要媳妇儿！既然这张主板也是双人床！
我建议你关注一下E5-1680v3可好？这款是独行侠型服务器用CPU中性能很高的一款了，而单路主板还便宜:)

作者
Author: lao7 时间: 2015-1-6 16:40
好谢谢我在关注有些大体系耗内存的算法估计还得多核，高频，和高内存。
手头已经有一个AMD的32核心的了，就是主频太低2.1G。当时不懂。看了前辈们的指点才了解一些。
谢谢指点！

作者
Author: lonewolf659 时间: 2015-1-8 20:48
:):):)小卒加油

作者
Author: syjohn 时间: 2015-1-9 09:14
本帖最后由 syjohn 于 2015-1-9 09:24 编辑

写的很棒啊，期待有大神写下 MD的攒机教程，虽然管理员写了，但是时代变化太快了哈ps：高主频和大容量的内存对高斯和动力学来说都是最重要的

作者
Author: sobereva 时间: 2015-1-9 12:35

syjohn 发表于 2015-1-9 09:14
写的很棒啊，期待有大神写下 MD的攒机教程，虽然管理员写了，但是时代变化太快了哈ps：高主频和大容量的内 ...

大容量内存对于分子动力学是不需要的。而且分子动力学程序的并行效率比起高斯都要高很多，所以频率和核数之间的关系不能一视同仁。
我写的单路攒机配置对于目前也是完全适用的。如果形势有变，需要进行调整，我会进行相应更新的。

作者
Author: helpme 时间: 2015-1-11 21:56

ChaosChiao 发表于 2015-1-6 14:22
关键是很多科研部门不能自己攒机，必须要走央采。

自己装机的最大难点，不在于技术（大不了向楼主请教），
而在于报销制度。而且，这个报销制度还越来越严。
这是最大的痛苦。

作者
Author: syjohn 时间: 2015-1-13 20:25

sobereva 发表于 2015-1-9 12:35
大容量内存对于分子动力学是不需要的。而且分子动力学程序的并行效率比起高斯都要高很多，所以频率和核数 ...

但是sob大神，对于我的经验来看，我用的是自己攒的i7电脑，8G内存确实要比16G内存要慢一些，在其他硬件条件不变的情况下，所以我感觉还是有些许提升，如果不是这方面的原因，还请多多指教~！

作者
Author: sobereva 时间: 2015-1-13 21:43

syjohn 发表于 2015-1-13 20:25
但是sob大神，对于我的经验来看，我用的是自己攒的i7电脑，8G内存确实要比16G内存要慢一些，在其他硬件条 ...

得具体看情况，对于什么程序什么任务慢。
动力学程序跑一般大小的体系根本毫不了多少内存，更不会因为内存不够而调用虚拟内存，8G和16G容量不会有任何差异。
8G和16G能体现出差异的情况，要么是单个任务本身内存消耗巨大，要么就是开了很多个程序把内存几乎占满。

作者
Author: fcfsdu 时间: 2015-1-18 01:48
一直相信攒机是王道

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-19 12:53

ChaosChiao 发表于 2015-1-6 14:22
关键是很多科研部门不能自己攒机，必须要走央采。

央采的机器，性价比太低。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-1-19 12:56
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-1-19 13:11 编辑

fcfsdu 发表于 2015-1-18 01:48
一直相信攒机是王道

新来的小孩儿们，很少有攒机的了。甚至连拆开机箱或者笔记本后盖的勇气都没有。也就是我们这些1981-1986，最多不超过1988年出生的人，经历了大规模的攒机时代。你知道吗，有些新小孩儿连X86和ARM都分不清，说：“这台服务器只有八个核心啊？我手机都四个核心了哦”。
有些新小孩儿只见过笔记本，连台式机见得都少。当他见到我们那一排排的2U节点，整齐的镶嵌在机柜中，大喊了一声：“哇喔，好多路由器啊”（说实话，她能正确喊出“路由器”这三个字就已经让我很惊讶了）
至于RAM和ROM更是概念极度混淆，会喊出：“哦，那台服务器的内存居然只有32G？我的pad的内存都是64G哦~”
更有甚者，某些人甚至连内存和硬盘都傻傻滴分不清，张嘴就来“哦？咱们的最新服务器的内存是128G？我的笔记本的内存都一千G了！”

还有一次，某人想给让我给他自己的笔记本加一条内存条。我打开螺丝刀盒，就准备拆后盖。人家急急忙忙阻拦我：“内存卡不是插进去卡槽就可以了吗？为什么要拆开机器？”我也是一愣，不拆开机器怎么插入内存槽子呀？弄了半天才知道，敢情他把笔记本内存条和手机外置SD内存卡混为一谈了，怪不得一开始还说：“这个电脑内存条也不过4G而已嘛，怎么就这么大个儿……”
每到这时候，我都会憋笑到内伤

作者
Author: yflchx 时间: 2015-1-20 10:22

yjcmwgk 发表于 2015-1-19 12:56
新来的小孩儿们，很少有攒机的了。甚至连拆开机箱或者笔记本后盖的勇气都没有。也就是我们这些1981-1986 ...

这里面有计算机随时间逐渐普及的影子。

作者
Author: fcfsdu 时间: 2015-1-21 00:44

yjcmwgk 发表于 2015-1-19 12:56
新来的小孩儿们，很少有攒机的了。甚至连拆开机箱或者笔记本后盖的勇气都没有。也就是我们这些1981-1986 ...

楼主是在说段子么。。

你这个时间段我个人感觉归纳得太准确了，差不多就在这个年纪之内的，从事该行业的大部分人有过折腾攒机的经历，我相信我会一直坚持下去。

作者
Author: youyno 时间: 2015-1-22 09:19
(ˇˍˇ）想～让楼主普及一下这个超线程的优劣，为何一定要关掉超线程，超线程下的四核并行和机械双核有什么区别？

作者
Author: 五十八 时间: 2015-6-8 15:17
啊呀呀可是es正显得2647 v3店家要1k8 靠谱吗啊啊啊

作者
Author: njuctchem 时间: 2015-6-15 08:42
看小卒写的文章，就是开心幽默

作者
Author: fankui1990129 时间: 2015-7-16 16:09
你好，请问一下如何linux和win双系统是怎么实现的。我现在自学高斯，我还是在读硕士生，只配了一台2G内存、四核CPU的台式，而且是win系统的G。

我现在急于实现双系统，之前我只会双win系统，不会win和Linux。我有一个学机械的同学和我说，用虚拟机也许可以，请问他的建议有帮助么？

谢谢！！

作者
Author: sobereva 时间: 2015-7-16 18:03

fankui1990129 发表于 2015-7-16 16:09
你好，请问一下如何linux和win双系统是怎么实现的。我现在自学高斯，我还是在读硕士生，只配了一台2G内存、 ...

你的内存太小，跑虚拟机吃力，建议升到8G。
虚拟机跑Linux是最佳选择，除非你的机子几乎只用Linux，那可以装个独立的。
把Linux盘放光驱里按提示一步步操作即可，装完了开机后就能看见菜单选择进哪个系统。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-7-20 15:27

helpme 发表于 2015-1-11 21:56
自己装机的最大难点，不在于技术（大不了向楼主请教），
而在于报销制度。而且，这个报销制度还越来越严 ...

华电？你是丁老师么？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-7-24 04:23

sobereva 发表于 2015-7-16 18:03
你的内存太小，跑虚拟机吃力，建议升到8G。
虚拟机跑Linux是最佳选择，除非你的机子几乎只用Linux，那可 ...

啊？在Win上用虚拟机装Linux跑Gaussian吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-7-24 06:46

liyuanhe211 发表于 2015-7-24 04:23
啊？在Win上用虚拟机装Linux跑Gaussian吗？

是的

作者
Author: bluewhale 时间: 2015-7-30 21:21
2W元确实少一点，2个CPU就要近2W, 再按4GB/核的标准配内存，光这些就要不少银子，算MD内存需求不大，算高斯，多配点内存，可以作scratch，这样可显著提高效率。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-8-17 16:37
本帖最后由 yjcmwgk 于 2015-8-17 16:42 编辑

liyuanhe211 发表于 2015-7-24 04:23
啊？在Win上用虚拟机装Linux跑Gaussian吗？

忒能折腾！
你呀，最好是买个mac电脑，在MAC OS X里装一个虚拟机，装一个红帽子或者centos系统进去，然后在linux里装一个虚拟机，虚拟机里装一个win7，然后在win7里再装一个安卓模拟器。很棒很酷毙吧

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-8-18 20:38

yjcmwgk 发表于 2015-8-17 16:37
忒能折腾！
你呀，最好是买个mac电脑，在MAC OS X里装一个虚拟机，装一个红帽子或者centos系统进去，然后 ...

故而表示惊讶。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-8-19 00:24

yjcmwgk 发表于 2015-8-17 16:37
忒能折腾！
你呀，最好是买个mac电脑，在MAC OS X里装一个虚拟机，装一个红帽子或者centos系统进去，然后 ...

虚拟机效率还是很高的而且用起来非常便利

至少对于vmware虚拟机，如果试图在虚拟机里再装虚拟机，程序会明确阻止这种不良企图。

作者
Author: dreamyeye 时间: 2015-10-25 18:09
楼主买品牌机那个报价是讲过的吗？品牌服务器能讲下多少价格呢？品牌服务器官网那些报价是不是太扯了？

作者
Author: xialaxiu 时间: 2015-10-29 05:48
哪个量化软件并行效率好？GAMESS？Q-CHEM？MOLPRO？还是什么软件？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-10-29 08:57

xialaxiu 发表于 2015-10-29 05:48
哪个量化软件并行效率好？GAMESS？Q-CHEM？MOLPRO？还是什么软件？

NWChem、ADF、DeMon2K都是号称并行效率高的量化程序。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-10-31 10:37

dreamyeye 发表于 2015-10-25 18:09
楼主买品牌机那个报价是讲过的吗？品牌服务器能讲下多少价格呢？品牌服务器官网那些报价是不是太扯了？

对，必须讲。十二块七毛的东西，你要从一块两毛七开始讲起

作者
Author: dreamyeye 时间: 2015-10-31 11:21

yjcmwgk 发表于 2015-10-31 10:37
对，必须讲。十二块七毛的东西，你要从一块两毛七开始讲起

去服务器公司的ban list上看看有没有你的名。

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-10-31 14:33

dreamyeye 发表于 2015-10-31 11:21
去服务器公司的ban list上看看有没有你的名。

哈哈，刚才纯属开玩笑啦。其实这些散件儿的报价信息都在网上有。我主要用ZOL网站查配置的曾经的价格，有时候在京东网站上查当前价格，然后你就知道这些散件儿的价格啦。至于处理器，你下载一个Intel ARK即可，Intel全部产品的规格价格等都在内。

作者
Author: dreamyeye 时间: 2015-10-31 16:14

yjcmwgk 发表于 2015-10-31 14:33
哈哈，刚才纯属开玩笑啦。其实这些散件儿的报价信息都在网上有。我主要用ZOL网站查配置的曾经的价格，有 ...

哈哈，把每顿饭每个菜的制作当成配服务器，买菜的时候也拦腰砍，最后做出物美价廉的饭菜，也会有相似的成就感吧？

作者
Author: 袁文凯GRRM 时间: 2016-3-1 14:34
对于高斯的并行计算的问题，我感觉不能一并而论的，从测试结果上来看，如果计算手法对于IO部分非常小的话，它的确还是可以随着核数的增加而计算时间减少的，并行效果不明显的这种说法只是说，可能没有达到理论上的并行效率，所以不能一概而论

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2016-9-15 06:10
楼主，你的基函数有多少？像我用6-31G*，16个线程根本就跑不满，效率肯定不高。换了大基组就可以满载了

作者
Author: laplacesuanzi 时间: 2023-9-22 15:04

bluewhale 发表于 2015-7-30 21:21
2W元确实少一点，2个CPU就要近2W, 再按4GB/核的标准配内存，光这些就要不少银子，算MD内存需求不大，算高斯 ...

您好，怎么样在虚拟机上实现Gaussian的并行计算？我是16核24线程的机子，采用的是Centos系统，谢谢

作者
Author: 孤忆梦影 时间: 2023-9-22 17:49

laplacesuanzi 发表于 2023-9-22 15:04
您好，怎么样在虚拟机上实现Gaussian的并行计算？我是16核24线程的机子，采用的是Centos系统，谢谢

单节点计算参考社长的帖子http://sobereva.com/439

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