计算化学公社

标题: 求助，山梨酸钾结构优化，钾成键 [打印本页]

作者
Author: 苑懿 时间: 2026-2-4 12:06
标题: 求助，山梨酸钾结构优化，钾成键
【问题描述】使用 Chem3D 软件分别构建山梨酸钾（PS，分子式C6H7KO2）的分子立体模型，通过 MM2 力场的能量最小化功能完成初步结构优化后将初步优化后的模型导入 Gaussian 软件，DFT B3LYP 泛函与 6-311G (d,p) 基组，对分子进行几何构型优化，设置分子电荷为 0、自旋多重度为 1，最后无虚频，就是成键了。
【求助】求教老师们，我想计算山梨酸钾的拉曼光谱，这样结果对吗，我看到有的说：优化后结构中 K 与羧基 O 之间存在较强离子作用，GaussView 中显示的连线为软件基于原子间距的自动判定，并非真实共价键。那我这个优化图能直接放进论文中么？如果不对，应该怎样计算呢？

作者
Author: KazusaT 时间: 2026-2-4 12:12
本帖最后由 KazusaT 于 2026-2-4 23:05 编辑

你如果觉得C和K有根键不好看保存图片的时候给他去掉不就得了

作者
Author: BinWang 时间: 2026-2-4 12:30
本帖最后由 BinWang 于 2026-2-4 12:32 编辑

考虑溶剂效应了吗？这个按理说是解离的，直接考虑阴离子，计算溶剂效应就行了

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2026-2-4 16:00
氢原子数都不对，山梨酸钾里哪来的 C=C 双键？建模先改对了再说。

作者
Author: 苑懿 时间: 2026-2-4 22:53

北大-陶豫发表于 2026-2-4 16:00
氢原子数都不对，山梨酸钾里哪来的 C=C 双键？建模先改对了再说。

有呀，7个氢，有碳碳双键呀

作者
Author: 苑懿 时间: 2026-2-4 23:02

BinWang 发表于 2026-2-4 12:30
考虑溶剂效应了吗？这个按理说是解离的，直接考虑阴离子，计算溶剂效应就行了

您说的这个确实可以考虑，水中会完全电离，算固体的话是否只能这样了？

我看到有论文计算青霉素G钾盐的，看到它结构优化O连接的是H而没有放K，但它后面讨论的是说实际计算是在真空条件下进行的。

作者
Author: 苑懿 时间: 2026-2-4 23:03

KazusaT 发表于 2026-2-4 12:12
你如果觉得C和K有根键不好看保存图片的时候给他去掉不就得了

嗯嗯如果可以的话

作者
Author: sobereva 时间: 2026-2-5 03:54
超级老生常谈的问题
认真看
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

我想计算山梨酸钾的拉曼光谱，这样结果对吗

不说要计算什么状态的拉曼光谱，根本没法回答。比如你若想跟晶体状态的拉曼对比，当前这样当成真空中的一个山梨酸钾分子算显然不对。

作者
Author: pal 时间: 2026-2-5 09:15
如果是晶体的话应该用周期性体系

作者
Author: BinWang 时间: 2026-2-5 09:27

苑懿发表于 2026-2-4 23:02
您说的这个确实可以考虑，水中会完全电离，算固体的话是否只能这样了？我看到有论文计算青霉素G ...

如果是晶体钾盐可以用vasp计算。我非常怀疑这种计算是否有意义。

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2026-2-5 15:19

苑懿发表于 2026-2-4 22:53
有呀，7个氢，有碳碳双键呀

抱歉，看成别的酸了

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