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标题: 如何快速知道哪个力场和水模型适合自己的蛋白体系 [打印本页]

作者
Author: charmm36 时间: 2026-2-4 23:26
标题: 如何快速知道哪个力场和水模型适合自己的蛋白体系

蛋白力场有很多，水模型也有和很多，如何知道哪个组合最适合自己的蛋白体系？求教，谢谢！

作者
Author: student0618 时间: 2026-2-5 00:10
力场的原文/相关说明通常都有写的，也有不少横测的文章讨论。一般蛋白如AmberFF14SB+TIP3P、Amberff19SB+OPC、CHARMM36+优化过的TIP3P；IDP专用力场等。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-2-5 04:05
这些关键性知识在北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）都讲得非常详细，参见培训里“溶剂模型”部分这页幻灯片：
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作者
Author: charmm36 时间: 2026-2-5 10:57

student0618 发表于 2026-2-5 00:10
力场的原文/相关说明通常都有写的，也有不少横测的文章讨论。一般蛋白如AmberFF14SB+TIP3P、Amberff19SB+OP ...

好的，谢谢！

作者
Author: charmm36 时间: 2026-2-5 10:58

sobereva 发表于 2026-2-5 04:05
这些关键性知识在北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）都讲得非常详细，参见 ...

好的，谢谢！

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