计算化学公社
标题:
求助:填充水后,gmx grompp因体系带8个电荷的报错的处理
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作者Author:
charmm36
时间:
6 day ago
标题:
求助:填充水后,gmx grompp因体系带8个电荷的报错的处理
我用gromacs做MD加完水后,运行gmx grompp因体系带8个电荷而终止,使用-maxwarn 1后正常运行,再通过gmx genion加抗衡离子后,不需要去掉-maxwarn 1重新执行前面的gmx grompp吧?后面可直接能量最小化吗?
作者Author:
KanbeKotori
时间:
6 day ago
不需要,没加抗衡离子之前带电太正常了。你之后需要带着你加了抗衡离子的电中性体系对应的结构和拓扑文件跑最小化和md就好了。
作者Author:
charmm36
时间:
6 day ago
KanbeKotori 发表于 2026-2-10 14:16
不需要,没加抗衡离子之前带电太正常了。你之后需要带着你加了抗衡离子的电中性体系对应的结构和拓扑文件跑 ...
好的,谢谢
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