标题: 求助：MD计算溶剂化自由能时如何去除位置限制的影响 [打印本页] 作者Author: MGRACE 时间: yesterday 22:20 标题: 求助：MD计算溶剂化自由能时如何去除位置限制的影响 老师们好，想要计算蛋白质分别在水相和表面粘附时的溶剂化自由能之间的差值得到结合能，计算使用gromacs，为了保证蛋白质在表面粘附，对蛋白质施加位置限制。不知道怎么在最后结果中去除位置限制的影响，看到有文献讲到使用mbar（The resulting 20 ns of production simulation data are reweighted through MBAR remove the effect of the lateral restraints and provide a whole-surface solvation free energy. https://doi.org/10.1073/pnas.2020205118）。但不知道具体操作方法，还请各位老师指教。