计算化学公社

标题: 小白希望了解双精度gmx [打印本页]

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Author: dodobird1 时间: 4 hour ago
标题: 小白希望了解双精度gmx
各位老师好，小白不是很了解分子动力学计算软件的一些情况，目前只用过单精度的gmx,看文献和资料了解到好像存在一个双精度版本的gmx，请问：
1. 双精度版本的gmx和单精度存在哪些区别？比如计算同样的体系计算结果会有不同吗？
2. 有没有什么必须用双精度gmx的场合？有没有什么场合双精度会明显更优？
3. 看到sob老师在444这片博文中的推荐，只推荐GeForce等单精度见长的游戏显卡，而表示计算卡这种双精度性能相对强一些的显卡性价比比较低，是说明进行双精度MD计算不常见吗，还是说完全可以替代？

作者
Author: student0618 时间: 3 hour ago
简单说就是双精度用的小数点更多，会跑得更慢。
一般情况其实单精度已经够用。

作者
Author: dodobird1 时间: 3 hour ago
另外，再追问一下，一般的大学课题组的服务器，基本上只看重单精度算力即可、不用管双精度？

作者
Author: UW_0728. 时间: 3 hour ago
其实在博文http://sobereva.com/457里面已经说得很清楚了：

一般计算只需要按照前述编译单精度版本就够了，但如果模拟刚开始就崩溃，有时候用双精度版本可解决，但计算比单精度版慢将近一倍、trr/edr等文件体积大一倍。另外，做正则振动分析时在能量极小化和对角化Hessian矩阵的时候一般也需要用双精度版以确保数值精度。注意，编译双精度版本时不支持GPU加速。

作者
Author: dodobird1 时间: 3 hour ago

student0618 发表于 2026-2-24 12:24
简单说就是双精度用的小数点更多，会跑得更慢。
一般情况其实单精度已经够用。

我明白双精度和单精度两个概念本身的区别
这就意味着计算结果上会多几位小数，仅此而已吗

作者
Author: dodobird1 时间: 3 hour ago

UW_0728. 发表于 2026-2-24 12:29
其实在博文http://sobereva.com/457里面已经说得很清楚了：

哦哦抱歉没有看到谢谢

注意，编译双精度版本时不支持GPU加速。

也就是说，即便有了像A100之类双精度性能较好的显卡，也不能有所帮助，只取决于cpu，是吗

作者
Author: dodobird1 时间: 3 hour ago
另外另外再再追问一句其他的常见分子动力学包裹如lammps charmm amber namd等有支持gpu加速的双精度版本的吗？

作者
Author: UW_0728. 时间: 3 hour ago

dodobird1 发表于 2026-2-24 12:33
哦哦抱歉没有看到谢谢

也就是说，即便有了像A100之类双精度性能较好的显卡，也不能有所帮助，只取决 ...

gromacs的GPU加速应该是只给单精度计算适配了。双精度性能好显卡当然也能用支持GPU加速编译的单精度版本，只是性价比低，不会比一般的双精度性能差的游戏显卡好到哪儿去；双精度性能好的更适合跑VASP、CP2K这类为双精度显卡适配CUDA加速的周期性体系量子化学计算程序

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