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标题: 求助:使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图 [打印本页]

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yangna11    时间: 4 hour ago
标题: 求助:使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图
各位老师好,我仔细阅读了sob老师的"使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)"这篇文章,并跟着演示了一遍,在双击ESPext.bat计算并生成记录极值点的surfanalysis.pdb文件中发现,有的静电势值为负值,但后面标注的是C原子,请问这应该如何更改。
例如:
HETATM    3  C   MOL A   1      -1.560   1.395   1.560  1.00 -3.49          C
HETATM   12  C   MOL A   1       2.701  -0.610  -1.732  1.00 -1.60          C
HETATM   13  C   MOL A   1       2.734  -0.592   1.730  1.00 -1.59          C
HETATM    5  C   MOL A   1      -1.502   1.382  -1.581  1.00 -3.49          C







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wal    时间: 3 hour ago
这里有什么问题需要更改
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yangna11    时间: 3 hour ago
wal 发表于 2026-2-24 15:58
这里有什么问题需要更改

因为C原子对应的是极大值,也就是正值,但是这里有几个负值也是显示C原子。不知道这样对不对
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wal    时间: 3 hour ago
yangna11 发表于 2026-2-24 16:23
因为C原子对应的是极大值,也就是正值,但是这里有几个负值也是显示C原子。不知道这样对不对

你从哪里学到的极大值一定是正值。。
y=-x^2 -1在x=0处的极大值不是-1么

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yangna11    时间: 2 hour ago
wal 发表于 2026-2-24 16:28
你从哪里学到的极大值一定是正值。。
y=-x^2 -1在x=0处的极大值不是-1么

那应该是我的理解出现错误了,还想请教一下老师这里
HETATM   13  C   MOL A   1       0.101   3.575   1.435  1.00 -0.61          C
HETATM   14  C   MOL A   1       1.371  -3.011  -1.820  1.00 -3.01          C
HETATM    2  O   MOL A   1      -4.798  -0.643  -1.883  1.00 -1.55          O
为什么-0.61显示极大值,用的是C原子标注,-3.01也显示极大值,也是C原子标注,在-0.61和-3.01之间的数-1.55却显示极小值,用的是O原子标注。
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wal    时间: 2 hour ago
本帖最后由 wal 于 2026-2-24 17:14 编辑
yangna11 发表于 2026-2-24 16:58
那应该是我的理解出现错误了,还想请教一下老师这里
HETATM   13  C   MOL A   1       0.101   3.575   ...

这里标注的是局域极大/极小值点,不是全局的,建议结合可视化理解
而且这个讲高数的时候应该学过吧,局域极大值不一定大于局域极小值

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yangna11    时间: 2 hour ago
wal 发表于 2026-2-24 17:12
这里标注的是局域极大/极小值点,不是全局的,建议结合可视化理解
而且这个讲高数的时候应该学过吧,局 ...

好的好的,谢谢老师




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