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标题: 我加入Na离子作为抗衡离子发现药剂和它作用相当强（严重影响药剂在矿物表面吸附研究） [打印本页]

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Author: 姑妈鱼丝 时间: yesterday 18:44
标题: 我加入Na离子作为抗衡离子发现药剂和它作用相当强（严重影响药剂在矿物表面吸附研究）
老师们好我想做一个药剂在矿物表面的吸附模拟，药剂全是阴离子形式存在的，我加入Na+离子作为抗衡离子发现药剂和抗衡离子作用力很强导致药剂不会去吸附矿物或者说吸附表现很弱就算设置的很远给他加以限制也会对药剂有很强烈的吸引这该怎么办呢我需要把Na+的itp参数改一下让它只作为使体系电荷平衡的存在吗（把sigma或者epsilon进行更改）这样会有效果吗

作者
Author: yxdd98 时间: yesterday 23:18
不建议这么做，随意根据需要设置LJ参数一方面可能导致模拟出现不合理的现象甚至报错，另一方面说不好听点这也算是编造数据了。首先你要明确下所使用的力场参数能否描述你的体系，如果这已经是你能找到的最合适的参数（比如有专门文献报道描述钠离子水溶液、纯药剂和矿物作用等效果不错），那可能是因为把这些参数组合在一起时缺少专门的优化了，个人的一点经验，对于离子体系，可以考虑电荷缩放，虽然这样子也有人为性，但的确有不少文献提到电荷缩放的方法来描述离子在溶液中的极化，你可以考虑下，论坛里也有相关讨论。

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