计算化学公社
标题:
关于反应机理计算,使用的泛函和基组的求助
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作者Author:
Dave666
时间:
yesterday 20:46
标题:
关于反应机理计算,使用的泛函和基组的求助
我使用了BP86-D3(BJ)/Def2-TZVP计算了一个反应机理。这个机理涉及的反应体系还是比较大的,约150个原子。
然后审稿人回复:单一的DFT方法不足以证明结论,特别是没有提供和与ab initio方法基准比较的情况下。(no benchmarking versus ab initio methods)
麻烦请教下老师们,在这种情况下,我是应该在多使用几个不同的DFT泛函计算?还是得找一个ab initio计算呢?有什么比较适合的ab initio方法呢,之前没怎么用过。。。
作者Author:
BinWang
时间:
yesterday 20:59
本帖最后由 BinWang 于 2026-2-28 21:06 编辑
有机反应机理可以考虑wb97xd,b3lyp-d3.后者比较快,前者精度高。小基组优化,大基组算单点能。可以参考这篇文章的做法回复审稿人,仔细看这两篇文章,适当引用。
https://www.nature.com/articles/s42004-020-00373-2
,这篇文章的SI里面以及对审稿人测试泛函的要求都有回复。这篇文章对单点能的校正公式给的很清楚
https://www.nature.com/articles/s42004-022-00751-y
作者Author:
sobereva
时间:
yesterday 21:14
“ab initio计算”这种说法没意义,审稿人显得很外行。比如HF倒属于ab initio,但结果巨烂。至少他应该说成advanced ab initio methods
BP86属于比较过时的泛函,对于反应的计算加了D3校正也无济于事,如今十分不推荐拿这个算反应机理。没有你的体系、反应的具体信息,没法告诉你用什么方法最适当,只能先推荐你仔细看下文,结合实际情况判断
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272
(
http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
)
楼上说的B3LYP-D3算弱相互作用能不错,做结构优化通常也很适合(见
http://sobereva.com/557
),但计算反应能、势垒的话是下策,精度在目前主流泛函里属于中低档。wB97XD用于有机反应不错(但不拔尖),但对于金属-有机反应不推荐。
另推荐看
谈谈量子化学研究中什么样的benchmark才有意义
http://sobereva.com/554
(
http://bbs.keinsci.com/thread-17826-1-1.html
)
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
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