计算化学公社

标题: 用vmd画ESP图，无法调色 [打印本页]

作者
Author: 微塑料 时间: 2026-3-1 18:13
标题: 用vmd画ESP图，无法调色
在Linux系统里的Multiwfn，我按照http://sobereva.com/612里面的步骤输入数字（如图） (, 下载次数 Times of downloads: 13) ，得到了两个cub文件，把这两个文件同时拖入vmd在进行调整，但是无论怎么调色，图片都是 (, 下载次数 Times of downloads: 11) ，纯白色，没有什么明显的区别。不用脚本的方法是因为自己的电脑算不动这个体系，只能借助服务器去算。

作者
Author: singes 时间: 2026-3-1 18:44
可能是VMD的颜色范围没对应好你的计算值范围，你的计算结果范围都在它默认值的中间值附近，所以不红不蓝。

作者
Author: 李唯一 时间: 2026-3-1 19:25
本帖最后由李唯一于 2026-3-1 19:26 编辑

你把算完的文件传到你自己的电脑上不就能用脚本了吗，我都是计算用服务器，处理数据用自己的笔记本电脑

作者
Author: SharkYYX2025 时间: 2026-3-1 19:45
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2026-3-1 20:05 编辑

你是把cub直接拖进去了吗，这个载入方法和原贴说的好像不是一个意思，ESP用vmd显示也有脚本的。可以把cub文件压缩用网盘传上来看看，或者截图vmd里rep窗口的样子

使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示 http://sobereva.com/443
注意看最后一段

可以随便找个小分子在自己电脑算一下ESP（有现成的fch文件），然后拿vmd画图试试。判断一下是新算的cub有问题还是载入有问题，或者装的vmd有问题

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-1 20:56
自己参照txt文件里的命令把电子密度和静电势的cub文件在服务器上算好、恰当命名后放到VMD目录下，直接用下文的ESPiso命令绘制。VMD不熟的人不要自己折腾VMD
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2026-3-3 10:41
本帖最后由睡觉不打鼾于 2026-3-3 10:46 编辑

纯手动教程：
(, 下载次数 Times of downloads: 11)

估计是最后一步没调对数值范围，范围过大导致所有等值面都在色块中间，所以是白色

作者
Author: 微塑料 时间: 2026-3-4 19:36

sobereva 发表于 2026-3-1 20:56
自己参照txt文件里的命令把电子密度和静电势的cub文件在服务器上算好、恰当命名后放到VMD目录下，直接用下 ...

感谢，改名后，正常了

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