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标题: md计算步骤以及电荷选取提问 [打印本页]

作者
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GHR1111    时间: 4 hour ago
标题: md计算步骤以及电荷选取提问
最近在计算电解液的md,使用的是lammps opls力场,在进行md前统一对有机小分子进行优化,在Gaussian中使用的def2tzvp进行的结构优化,并添加了smd,设置了溶剂的eps。然后导入ligpargen获取力场参数,multiwfn获取1.2cm5的电荷。想请问以上步骤是否合理。def2tzvp精度是否太高,因为组内师兄也有在md前用ccpvdz进行结构优化的,精度太高是不是也不太好。第二个问题是,阴阳离子是否也需要在溶剂的smd下进行结构优化,对于阴阳离子的力场参数和电荷我直接采用的文献中opls力场下的值,想请问阴阳离子电荷是否可以直接用文献中的,还是需要结构优化完后重新计算cm5电荷呢
作者
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Stardust0831    时间: 17 min ago
def2tzvp够用的,计算级别统一就行、不存在“精度太高是不是也不太好”的问题,你能算动结构优化那说明分子也都不大(我个人倾向于B3LYP-D3/def2-SVP结构优化、B3LYP-D3/def2-TZVP单点,省一些算力开销,此处基组可以不统一的原因见:浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组)。ccpvdz是给post-HF等理论方法用的,给普通杂化泛函有些浪费。如果只是用于动力学模拟初始结构的建模,只需要结构合理即可,不需要细致的dft的优化,文献里的力场如果兼容、可以直接用文献的。




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