计算化学公社

标题: 求助,vmd误装到根目录导致库冲突 [打印本页]

作者
Author:
Bamind    时间: 2026-3-6 11:13
标题: 求助,vmd误装到根目录导致库冲突
各位大佬,本人安装vmd时误装到根目录下,导致库冲突打不开文件系统了
运行指令显示如下
sudo ldconfig
ldd /lib/x86_64-linux-gnu/libtracker-sparql-3.0.so.0 | grep sqlite
libsqlite3.so.0 => /usr/local/lib/vmd/libsqlite3.so.0 (0x000076a9cc400000)
sudo nautilus
nautilus: symbol lookup error: /lib/x86_64-linux-gnu/libtracker-sparql-3.0.so.0: undefined symbol: sqlite3_value_free


libtracker-sparql-3.0.so.0 依赖的 libsqlite3.so.0 被解析为 /usr/local/lib/vmd/libsqlite3.so.0,而非系统默认的路径(如 /lib/x86_64-linux-gnu/libsqlite3.so.0
求助是否有解决方案,重装Ubuntu能否解决此问题?


作者
Author:
sobereva    时间: 2026-3-7 06:09
把VMD目录删掉再看
作者
Author:
Bamind    时间: 2026-3-7 23:00
sobereva 发表于 2026-3-7 06:09
把VMD目录删掉再看

老师,现在VMD目录无法打开,整个文件系统都打不开了
作者
Author:
sobereva    时间: 2026-3-8 09:27
Bamind 发表于 2026-3-7 23:00
老师,现在VMD目录无法打开,整个文件系统都打不开了

我不用Ubuntu,如果此系统有救援模式,用救援模式在命令行里对文件进行操作
作者
Author:
Tenshi65535    时间: 2026-3-8 15:24
用patchelf把libsqlite3.so.0重新链接到系统默认的so应该可以解决
无法挂载文件系统的话可以在livecd里面操作
作者
Author:
Bamind    时间: 2026-3-9 08:36
Tenshi65535 发表于 2026-3-8 15:24
用patchelf把libsqlite3.so.0重新链接到系统默认的so应该可以解决
无法挂载文件系统的话可以在livecd里面 ...

谢谢老师,请问这样操作后VMD还能正常使用吗?不行的话可能直接重装系统了
作者
Author:
Tenshi65535    时间: 2026-3-9 20:02
Bamind 发表于 2026-3-9 08:36
谢谢老师,请问这样操作后VMD还能正常使用吗?不行的话可能直接重装系统了

无法保证, 这个操作只能解决你这一个问题
不过推测也有别的so冲突问题 保险&便捷起见不如备份重装





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3